KEGG

Метаболические пути. KEGG.

Поиск сведений о субстрате и продукте в KEGG.

Субстрат Продукт Название Pyruvate (Пируват) L-Isoleucine (L-Изолейцин) Идентификатор C00022 C00407 Структурная формула C₃H₄O₃ C₆H₁₃NO₂

Поскольку для изолейцина в KEGG не указан метаболический путь, в таблице и далее приведен L-изолейцин.

Поиск метаболического пути

Текст запроса для раскрашивания субстрата, продукта и ферментов:
C00022 red
C00407 green
1.2.4.1 yellow
2.2.1.6 yellow
1.1.1.86 yellow
5.4.99.3 yellow
4.2.1.9 yellow
2.6.1.42 yellow
1.4.1.9 yellow
Название карты пути:
ko00290 Valine, leucine and isoleucine biosynthesis

Поиск метаболического пути

Общее число превращений пирувата в L-изолейцин равно 6.

Таблица 1. Возможных путь превращения пирувата в L-изолейцин по данным метаболической карты "Биосинтез валина, лейцина и изолейцина".

Этап	Ферментативная реакция	EC number	R number
1	Pyruvate + Thiamin diphosphate <=> 2-(alpha-Hydroxyethyl)thiamine diphosphate + CO2	EC 1.2.4.1 or EC 2.2.1.6	R00014
2	2-Oxobutanoate + 2-(alpha-Hydroxyethyl)thiamine diphosphate <=> (S)-2-Aceto-2-hydroxybutanoate + Thiamin diphosphate	EC 2.2.1.6	R04673
3	(S)-2-Aceto-2-hydroxybutanoate <=> (R)-3-Hydroxy-3-methyl-2-oxopentanoate	EC 1.1.1.86 or EC 5.4.99.3	R05069

Исследование метаболического пути в других организма

Таблица 2. Возможность пути превращения пирувата в L-изолейцин в различных организмах с известными полными геномами.

Организм	Возможна ли цепочка реакций (да/нет/неизвестно)	Обоснование
Escherichia coli	нет	неизвестен ген фермента, катализирующего 6 стадию (EC 1.4.1.9)
Haemophilus influenzae Rd KW20	нет	неизвестен ген фермента, катализирующего 6 стадию (EC 1.4.1.9)
Methanococcus janaschii	нет	неизвестен ген фермента, катализирующего 6 стадию (EC 1.4.1.9)
Arabidopsis thaliana	нет	неизвестен ген фермента, катализирующего 6 стадию (EC 1.4.1.9)
Homo sapiens	нет	известно лишь 2 гена для ферментов из 7 необходимых

На главную