В качестве эукариота я выбрал Cannabis sativa, ибо
а) это растение, а растения круче животных;
б) у неё хромосомное определение пола (XX и XY), всё как у людей в почти прямом смысле слова;
в) однажды в школе нас заставили слушать лекцию о вреде психотропных веществ и странный мужчина 47 с половиной раз повторил слово тетрагодраканнабинол и у меня случился импринтинг;
г) самое главное: женские особи C. sativa называются матёрками, а мужские - посконями.На фотографии справа - матёрка);
д) у этого растения оказалась отсеквенированной митохондрия и это забавно.
При запросе "Cannabis sativa" NCBI выдаёт 14 находок, из которых выбранный мной геном - референсный (то есть в ручную выбранный сотрудниками NCBI как качественный, с которым сравниваются остальные).
У конопли 20 аутосом в диплоидной (спорофитной) фазе и одна пара половых хромосом X/Y.
Ниже в таблице приведена информация по выбранной сборке:
| Идентификатор GenBank | GCA_900626175.2 |
|---|---|
| Идентификатор RefSeq | GCF_900626175.2 |
| Размер генома | 875.7 Mb |
| N50 scaffold | 91.9 Mb |
| N50 contig | 2 Mb |
| L50 scaffold | 5 |
| L50 contig | 102 |
Небольшие пояснения: для какого-либо элемента (скэффолда, контига) сборки генома значение NM, где M ∈ [0; 100] - это длина элемента, для которого M% всех нуклеотидов сборки содержится в подобных элементах такой-же или большей длины. Для какого-либо элемента (скэффолда, контига) сборки генома значение LM, где M ∈ [0; 100] - это наименьшее число элементов, в которых содержится M% нуклеотидов сборки.
Картинки матёрки и тетрагидроканнабинола - из Википедии.
А это статья канадцев, которые отсеквенировали коноплю и рассказали про её хромосомы.