Общие сведения о белке GlpF.

Работа с программами FAR manager, Word, Excel.

Глицерольный транспортный белок (the glycerol facilitator)
из Escherichia coli, штамм К-12.

  • Сокращенное название: GlpF
  • Ген:glpF
  • Положение гена в геноме: (4114825..4115670)
  • Общая длина последовательности: 281 аминокислотный остаток
  • Молекулярная масса:29743 а.е.м.

    • Нажмите на картинку, чтобы рассмотреть поближе.

    Аминокислотная последовательность:
    MSQTSTLKGQCIAEFLGTGLLIFFGVGCVAALKVAGASFGQWEISVIWGLGVAMAIYLTA
    GVSGAHLNPAVTIALWLFACFDKRKVIPFIVSQVAGAFCAAALVYGLYYNLFFDFEQTHH
    MIVRGSVESVDLAGTFSTYPNPHINFVQAFAVEMVITAILMGLILALTDDGNGVPRGPLAP
    LLIGLLIAVIGASMGPLTGFAMNPARDFGPKVFAWLAGWGNVAFTGGRDIPYFLVPLFGP
    IVGAIVGAFAYRKLIGRHLPCDICVVEEKETTTPSEQKASL

    Аминокислотный состав белка.

    Название 3-букв. обозначение 1-букв. обозначение Количество Mr Частота в долях
    Аланин Ала (Ala) A 34 89 0,121
    Аргинин Арг (Arg) R 7 132 0,025
    Аспарагин Асн (Asn) N 7 132 0,025
    Аспарагиновая кислота Асп (Asp) D 8 132 0,026
    Валин Вал (Val) V 26 117 0,093
    Гистидин Гис (His) H 5 155 0,018
    Глицин Гли (Gly) G 32 75 0,114
    Глутамин Глн (Gln) Q 9 146 0,032
    Глутаминовая кислота Глу (Glu) Е 7 146 0,025
    Изолейцин Иле (Ile) I 21 131 0,075
    Лейцин Лей (Leu) L 30 131 0,107
    Лизин Лиз (Lys) K 8 147 0,028
    Метионин Мет (Met) М 6 149 0,021
    Пролин Про (Pro) P 15 115 0,053
    Серин Сер (Ser) S 12 105 0,043
    Тирозин Тир (Tyr) Y 7 181 0,025
    Треонин Тре (Thr) Т 15 119 0,053
    Триптофан Трп (Trp) W 5 204 0,018
    Фенилаланин Фен (Phe) F 21 165 0,075
    Цистеин Цис (Cys) С 6 121 0,021

    Результаты сравнения с различными группами белков.
    (по частотам встречаемости аминокислот).

    Название групп белков Коэффициент корелляции
    Эубактериальные транспортные
    белки TC 2A     		0,9
    Белки кишечной палочки (Escherichia coli) 0,35
    Альфа-белки 0,64
    Бета-белки 0,69

    Вывод: до более детального изучения белка и поиска его в различных базах данных можно сделать вывод, что он транспортный (следовательно локализован в плазматической мембране), как и соответствующай группа эубактериальных белков (см. таблицу).

    По результатам сравнения с другими белками, данный не является полностью с альфа или бета - структурой и построен по совершенно иным правилам, чем белки кишечной палочки (Esherichia coli).

    Главная страница