Фрагмент вторичной структуры.

Работа с программой Rasmol.


Исследовался фрагмент

Паттерн образования водородных связей в альфа-спирали:
H(i >i +4) – наиболее распространенный,
но иногда встречаются: H(i> i +5 ) и H(i> i +2 ), H(i +3> i )
(например, между атомом кислорода метионина54 и атомом азота лейцина 56 , атомом кислорода треонина59 и атомом азота глицина64, атомом азота треонина59 и атомом кислорода валина62 соответственно).

Расположение бета атомов углерода относительно оси симметрии альфа-спирали:
на внешней стороне данной структуры (выделены на рисунке зеленым цветом).

Главная страница