Доменная структура белка глицеропоринa (GlpF).

База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью профиля-НММ.

Согласно базе данных PFAM в белке GlpF существует 1 домен, а также сигнальная пептидная последовательность.

Изображение доменной структуры GlpF_Ecoli:

Описание каждого домен по данным PFAM. 1. Сигнальная последовательность

  • Краткое название: сигнальный пептид (signal peptide)
  • Его расположение в последовательности: 1-31
  • Краткое описание свойств: сигнальная последовательность указывает на то, что данный белок будет секретирован или особым образом локализован в клетке (в мембране (как GlpF), ядре, ЭПР и.т.д.)

    2. Домен №1

  • Краткое название: MIP
  • Его расположение в последовательности: 9-227
  • Идентификатор записи в PFAM: PF00230
  • Краткое описание свойств домена: MIP (Major Intrinsic Protein) – семейство транспортных канальных белков, обладающих описаниями следующих функций: 1. специфический транспорт воды аквапорином и 2. транспорт небольших нейтральных растворенных молекул, таких как глицерол, глицериновым переносчиком.

    Наложение доменной структуры на пространственную структуру белка

    Красным цветом отмечен домен MIP, зеленым – сигнальная последовательность.

    Главная страница