| Главная | Семестры | Обо мне | Ссылки |
|---|
Белок репарации и рекомбинации ДНК RadA (DNA repair and recombination protein RadA) из генома археи Methanococcus voltae, штамм А3
Информация о белке и его гене, полученная из записи NC_014222 базы данных RefSeq с полным геномом археи, приведена в таблице 1. Трехмерную структуру белка RadA можно увидеть в работе следующего семестра
Таблица 1. Информация о белке репарации и рекомбинации ДНК RadA из генома археи Methanococcus voltae, штамм А3 (идентификатор белка в базе RefSeq YP_003707477.1)
| Вид информации | Квалификатор в записи генома | Значение |
|---|---|---|
| Локус гена в геноме | /locus_tag | Mvol_0845 |
| Имя гена | /gene | отсутствует |
| Идентификатор гена в базе данных NCBI | /db_xref="GeneID:..." | 9276067 |
| Начало гена в геноме | - | 959095 |
| Конец гена в геноме | - | 960063 |
| На какой цепи кодируется ген | - | Обратная |
| Длина гена (в парах нуклеотидов) | - | 969 |
| Идентификатор белка в базе данных NCBI Protein | /protein_id | YP_003707477.1 |
| Длина белка (в аминокислотных остатках) | - | 322 |
На рис. 1 показана окрестность в геноме гена описываемого белка.
Рис. 1. Геномная окрестность гена белка RadA из генома археи Methanococcus voltae, штамм А3.
Ген отмечен черной рамкой. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)
Из рисунка следует, что гены Mvol_0846 и Mvol_0847 сонаправлены с данным. Расстояния до гена Mvol_0846 составляет 652 пары нуклеотидов, до гена Mvol_0847 - 1173 пары нуклеотидов. Возможно, эти три гена находятся в одном опероне, так как они сонаправлены.