Практикум 2
A-форма ДНК B-форма ДНК Z-форма ДНК
В сторону большой бороздки обращены атомы C8,N7,C5,C6,N6
В сторону малой бороздки обращены атомы N9,C4,N3,C2,N1
| A-форма | B-форма | Z-форма | |
|---|---|---|---|
| Тип спирали (правая или левая) | Правая | Правая | Левая |
| Шаг спирали (Å) | 28 | 34 | 43 |
| Число оснований на виток | 11 | 10 | 12 |
| Ширина большой бороздки (номер нуклеотида с фосфатом) | 1.923 нм (11) | 1.814 нм (3) | 1.404 нм (8) |
| Ширина малой бороздки | 1.758 нм (9) | 0.999 нм (8) | 1.234 нм (12) |
Для задания 3 была взята дрожжевая аспартатная тРНК 1il2. Координаты четырех стеблей 5'901-907(3'972-966), 5'949-954(3'965-958), 5'926-932(3'944-938), 5'910-914(3'925-921). Неканонические пары оснований: U--G, T--A, PsU--G, C--PsU, A--G, A--A. Координаты дополнительных водородных связей:908--946, 917--955, 915--948, 916--959