Был получен из Swissprot как белок одного из организмов рода Rhizopus, относительно базальной группы грибов. Запускался tblastn по созданной нуклеотидной базе X5.fasta.
seqret sw:P29405 CytB.fasta, затем tblastn -query CytB.fasta -db X5.fasta > CytB.txt
ВыдачаВвиду низкого E-value(1e-58), наличия четырёх совпадающих участков длиной до 220 нуклеотидов в нескольких местах выравнивания, относительно немалой их идентичностью (57-75%), имеется гомолог в геноме Amoeboaphelidium
Был получен из Swissprot как белок одного из организмов рода Rhizopus, относительно базальной группы грибов. Запускался tblastn по созданной нуклеотидной базе X5.fasta.
seqret sw:P29405 FumH.fasta, затем tblastn -query FumH.fasta -db X5.fasta > FumH.txt
ВыдачаВвиду низкого E-value(0.0), наличия трёх совпадающих участков выравнивания, один из которых длиной около 400 нуклеотидов и identity 69%, имеется гомолог в геноме Amoeboaphelidium
Был получен из Swissprot как белок одного из организмов рода Rhizopus, относительно базальной группы грибов. Запускался tblastn по созданной нуклеотидной базе X5.fasta.
seqret sw:P29405 PGK1.fasta, затем tblastn -query PGK1.fasta -db X5.fasta > PGK1.txt
ВыдачаВвиду низкого E-value(2e-173), наличия пяти совпадающих участков в разных местах выравнивания, два из которых имеют длину свыше 400 нуклеотидов и identity 63%, имеется гомолог в геноме Amoeboaphelidium