Практикум 11
Базы данных: GO, KEGG, Reactome, STRING, Human Protein Atlas
Я выбрала для исследования белок с идентификатором FLAD1 и базу данных Human Protein Atlas. Выдача при поиске по базе данных представляет собой таблицу, из которой можно выяснить функции белка в организме человека. Данный белок представляет собой флавин адениндинуклеотид синтетазу. Имеет также 2 других ID, FAD1 и PP591. Обладает низкой тканевой и клеточной специфичностью. В основном расположен в белковых кластерах митохондрий и протеасом. Главное расположение экспрессии в клетках наблюдается в сперматидах. Является неблагоприятным диагностическим маркёром рака печени и почек. Катализирует формирование кофермента FAD. Является трансферазой - аденилирует FMN. Может быть вовлечён в митохондриальные заболевания. В норме не обнаруживается в крови. Обнаруживается в цитозоле. Далее имеется визуализация вышеперечисленных фактов.
Доступна информация о гене. Он расположен на хромосоме 1, на участке q21.3, соответствующие основания 154983338 - 154993111. Имеет 7 транскриптов. Есть ссылки на соответствующий ген в Ensembl, на продукты в Uniprot, neXtProt и Antibodypedia. Для каждого транскрипта на схеме ниже показаны участки связывания с антителами, фрагменты с наибольшей идентичностью к другим белками человека. Имеется таблица с различными вариантами сплайсинга, их длины и ссылки на другие базы данных.
