Последовательность белка в формате fasta:
> METK_ECOLI S-adenosylmethionine synthetase
MAKHLFTSESVSEGHPDKIADQISDAVLDAILEQDPKARVACETYVKTGMVLVGGEITTS
AWVDIEEITRNTVREIGYVHSDMGFDANSCAVLSAIGKQSPDINQGVDRADPLEQGAGDQ
GLMFGYATNETDVLMPAPITYAHRLVQRQAEVRKNGTLPWLRPDAKSQVTFQYDDGKIVG
IDAVVLSTQHSEEIDQKSLQEAVMEEIIKPILPAEWLTSATKFFINPTGRFVIGGPMGDC
GLTGRKIIVDTYGGMARHGGGAFSGKDPSKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADRCEIQVS
YAIGVAEPTSIMVETFGTEKVPSEQLTLLVREFFDLRPYGLIQMLDLLHPIYKETAAYGH
FGREHFPWEKTDKAQLLRDAAGLK
|
|
Таблица частотности остатков и их гидрофобность
| остаток |
частотность |
гидрофобность |
| A |
9,9% |
+ |
| C |
1,0% |
+ |
| D |
7,0% |
- |
| E |
6,8 |
- |
| F |
3,4% |
+ |
| G |
8,9% |
- |
| H |
2,3% |
- |
| I |
6,8% |
+ |
| K |
5,2% |
- |
| L |
7,3% |
+ |
| M |
2,6% |
+ |
| N |
1,8% |
- |
| P |
4,7% |
- |
| Q |
4,4% |
- |
| R |
4,7% |
- |
| S |
5,2% |
- |
| T |
6,3% |
- |
| V |
7,6% |
+ |
| W |
1,0% |
+ |
| Y |
3,1% |
+ |
| процент гидрофобности: |
42,71% |
| молекулярный вес белка: |
41525а.е.м. |
|