Последовательность белка в формате fasta:
> METK_ECOLI S-adenosylmethionine synthetase
MAKHLFTSESVSEGHPDKIADQISDAVLDAILEQDPKARVACETYVKTGMVLVGGEITTS
AWVDIEEITRNTVREIGYVHSDMGFDANSCAVLSAIGKQSPDINQGVDRADPLEQGAGDQ
GLMFGYATNETDVLMPAPITYAHRLVQRQAEVRKNGTLPWLRPDAKSQVTFQYDDGKIVG
IDAVVLSTQHSEEIDQKSLQEAVMEEIIKPILPAEWLTSATKFFINPTGRFVIGGPMGDC
GLTGRKIIVDTYGGMARHGGGAFSGKDPSKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADRCEIQVS
YAIGVAEPTSIMVETFGTEKVPSEQLTLLVREFFDLRPYGLIQMLDLLHPIYKETAAYGH
FGREHFPWEKTDKAQLLRDAAGLK
|
|
Таблица частотности остатков и их гидрофобность
остаток |
частотность |
гидрофобность |
A |
9,9% |
+ |
C |
1,0% |
+ |
D |
7,0% |
- |
E |
6,8 |
- |
F |
3,4% |
+ |
G |
8,9% |
- |
H |
2,3% |
- |
I |
6,8% |
+ |
K |
5,2% |
- |
L |
7,3% |
+ |
M |
2,6% |
+ |
N |
1,8% |
- |
P |
4,7% |
- |
Q |
4,4% |
- |
R |
4,7% |
- |
S |
5,2% |
- |
T |
6,3% |
- |
V |
7,6% |
+ |
W |
1,0% |
+ |
Y |
3,1% |
+ |
процент гидрофобности: |
42,71% |
молекулярный вес белка: |
41525а.е.м. |
|