Классификация функций. Коды ферментов.

1. Расшифровка кода фермента.

Код фермента - EC 2.4.2.14
EC 2 - Transferase (Трансферазы)
EC 2.4 - Glycosyltransferases (Гликозилтрансферазы)
EC 2.4.2 - Pentosyltransferases (Пентозилтрансферазы)
EC 2.4.2.14 - Amidophosphoribosyltransferase (Амидофосфорибозилтрансфераза)

Информация предоставлена сайтом International Union of Biochemistry and Molecular Biology.

2. Сравнение последовательности ферментов с одинаковым кодом из эволюционно далеких организмов.

С помощью SRS в базе UniProt осуществляли поиск фермента с кодом EC 2.4.2.14 в трех организмах (бактерии Escherichia coli K-12, археи Methanococcus jannaschii и человека) при помощи запроса ((([uniprot-AllText:EC*] & [uniprot-AllText:2.4.2.14*]) | [uniprot-AllText:EC 2.3.1.61*]) & (([uniprot-ID:*_ECOLI*] | [uniprot-ID:*_HUMAN*]) | [uniprot-ID:*_METJA*])). В результате поиска для каждого организма было найдено ровно по одному ферменту.

Сравнение доменной структуры найденных белков:

    Фермент 1 (Escherichia coli (strain K12)) Фермент 2 (Saccharomyces cerevisiae) Фермент 3 (Homo sapiens)
Домен Идентификатор, название домена Pfam Положение в последовательности Положение в последовательности Положение в последовательности
Домен 1 PF00310 (GATase_2) 2-211 2-200 12-236
Домен 2 PF00156 (Pribosyltran) 270-389 270-397 312-419