Метаболические пути. KEGG.

1. Поиск сведений о субстрате и продукте в KEGG.

Субстрат:

Продукт:

Информация предоставлена сайтом KEGG.

2. Поиск метаболического пути.

3. Описание последовательности реакций.

Общее число этапов превращения субстрата в продукт - 4.

Таблица. Возможный путь превращения глутамина в оротат по данным метаболической карты пуримидинного метаболизма.

Этап Ферментативная реакция EC number R number
1 2 ATP + L-Glutamine + HCO3- + H2O <=> 2 ADP + Orthophosphate + L-Glutamate + Carbamoyl phosphate 6.3.5.5 R00575
2 Carbamoyl phosphate + L-Aspartate <=> Orthophosphate + N-Carbamoyl-L-aspartate 2.1.3.2 R01397
3 (S)-Dihydroorotate + H2O <=> N-Carbamoyl-L-aspartate 3.5.2.3 R01993
4 (S)-Dihydroorotate + Oxygen <=> Orotate + H2O2 1.3.3.1 R01867

4. Исследование метаболического пути в других организмах.

Таблица. Возможность пути превращения глутамина в оротат в различных организмах с известными полными геномами.

Организм Возможна ли цепочка реакций
(да/нет/неизвестно)
Обоснование
Escherichia coli Да Присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций
Haemophilus influenzae Rd KW20 Нет Из 4 необходимых ферментов найдены гены только для одного
Methanococcus janaschii Нет Неизвестен ген фермента, катализирующего 3 стадию (EC 3.5.2.3)
Arabidopsis thaliana Неизвестно Метаболической карты не существует
Homo sapiens Да Присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций