| « Описание генома бактерии Chloroflexus aurantiacus штамм J-10-fl |
Описание белка дегидратазы (dehydratase) из генома бактерии Chloroflexus aurantiacus, штамм J-10-fl
Информация о белке и его гене, полученная из записи NC_010175.1 с полным геномом организма в базе данных Refseq, представлена в Таблице 3.
| Вид информации | Квалификатор в записи генома | Значение |
| Локус гена в геноме | /locus_tag | Caur_0173 |
| Имя гена | /gene | отсутствует |
| Идентификатор гена в базе данных NCBI Gene | /db_xref=”GeneID:…” | 5824747 |
| Начало гена в геноме | — | 218482 |
| Конец гена в геноме | — | 219540 |
| На какой цепи кодируется ген (прямая или обратная) |
— | обратная |
| Длина гена (в парах нуклеотидов) | — | 1059 |
| Идентификатор белка в базе данных NCBI Protein |
/protein_id | YP_001633816.1 |
| Длина белка (в аминокислотных остатках) |
— | 352 |
Рисунок 5. Геномная окрестность гена белка дегитратазы из генома бактерии Chloroflexus aurantiacus, штамм J-10-fl.
Ген выделен черной рамочкой. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)
Из рисунка следует, что 6 генов-соседей с 5’-конца со-направлены с данным. Расстояние с соседом с 5’-конца – 21 пар нуклеотидов, с 3’-конца – 1000 пар нуклеотидов. Вероятнее всего, сосед с 5’-конца и исходный ген находятся в одном опероне. Не исключено также и то, что в оперон могут входить следующие 5 генов с 5’-конца (см. Рисунок 5).
По данной ссылке можно скачать файл в формате фаста с последовательностью аминокислот данного белка.