Учебный сайт Светланы Яровенко
» Семестры » Второй семестр » Работа в PubMed

Нобелевская премия 2012 года по медицине и физиологии

Джон Гёрдон
Рисунок 1. Джон Гёрдон. Лауреат Нобелевской премии 2012 года.
Фото U. Montan
Синъя Яманака
Рисунок 2. Синъя Яманака.
Лауреат Нобелевской премии 2012 года.
Фото U. Montan

Лауреатами Нобелевской премии по физиологии и медицине 2012 года стали Джон Гёрдон (рисунок 1) и Синъя Яманака (рисунок 2) "за работы в области биологии развития и получения индуцированных стволовых клеток" [1].

Долгое время считалось, что соматические клетки не могут вернутся в абсолютно недифференциированное состояние, но возможность того, что эти клетки можно каким-то образом дедифференциировать, не отрицалась полностью [2].


Первую попытку напрямую выяснить, есть ли потенциал у зрелых клеток перейти в недеференциированное состояние, осуществили Роберт Бриггс и Томас Кинг.

В качестве объекта исследования была выбрана лягушка Rana pipiens. В оплодотворённое яйцо, лишённое ядра, учёные поместили эмбриональное ядро. В итоге, из этого яйца смог развиться полноценный головастик. Но попытки использовать тот же метод с ядром более дифференциированной клетки провалились. Зародыш, достигнув стадии бластулы, погибал [3].


Джон Гёрдон в качестве объекта выбрал другую амфибию – Xenopus laevis. С помощью ультрафиолетового излучения он лишал ядра оплодотворённое яйцо. После этого туда помещалось ядро из клетки кишечного эпителия головастика, то есть ядро дифференциированной клетки (Схема метода изображена на рисунке 3). В некоторых случаях из этого яйца действительно развивались головастики [4]. (Позже аналогичный метод был использован при клонировании овечки Долли в 1997 году, а потом и других млекопитающих.)

Метод, использованный Гёрдоном в исследовании

Рисунок 3. Метод, использованный Гёрдоном в исследовании. (1) — ядро клетки уничтожается ультрафиолетовым излучением. (2) — помещается ядро из дифференциированной клетки кишечного эпителия головастика. (3) — в результате из некоторых клеток развиваются головастики.
Рисунок взят из статьи [2].

Таким образом, Гёрдон доказал возможность перехода ядра соматической клетки в состояние плюрипотентности. Но вопрос, можно ли перепрограммировать клетку в плюрипотентное состояние, а главное, как, остался открытым.


Сорок лет спустя японского учёного, Яманака Синъя, вплотную занялся этой проблемой, начав с изучения эмбриональных стволовых клеток, которые впервые были описаны и культивированы Мартином Эвансом, Нобелевским лауреатом по физиологии и медицине 2007 года. Яманака пытался найти факторы, сохраняющие плюрипотентное состояние у данных клеток. В результате было выделено 24 фактора транскрипции, которые, вероятней всего, отвечали за поддержания данного состояния.

После серии экспериментов по внедрению всех 24 генов, кодирующих эти факторы транскрипции, в фиробласты кожи мыши, учёный и сотрудники его лаборатории определили четыре фактора транскрипции. Именно благодаря ним фиробласты преобразовывались в плюрипотентные стволовые клетки. Эти клетки Яманака назвал индуцированными стволовыми (iPS cells) [5].

Уже в 2007 удалось создать индуцированные стволовые клетки человека [2].


Отрытия, сделанные данными учёными, сделали своего рода переворот в науке. На данный момент уже доказано, что индуцированные стволовые клетки могут дать начало различным клеткам тела. А значит, считавшееся ранее необратимым, дифференциированое состояние клетки уже сегодня можно преобразовать в плюрипотентное, а следовательно, потом получить из этих клеток необходимые нам, например, нейроны или кардиомициты – мышечные клетки сердца.

На данный момент эту возможность пытаются использовать в медицине, синтезируя iPS-клетки человека, в частности для лечения такого заболевания, как болезнь Альцгеймера; а также для разработки и тестирования новых терапевтических методов.

Работа в PubMed

PubMed — это текстовая база данных, созданная Национальным центром биотехнологической информации (NCBI). Здесь находится огромное количество статей на медицинские и биологические темы.

Оригинальная статья.

Для работы с базой данных PubMed я выбрала статью второго лауреата — Синъи Яманаки.


Для того чтобы её найти я использовала следующий запрос:
"Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors[title]".

Поиск сразу же выдал нужную статью, а в гафе "Search details" был указан уникальный идентификатор статьи — 16904174[uid].

Ради эксперимента я ввела в качестве запроса просто название статьи без маркировки "[title]". Поиск выдал 3 статьи, а приэтом PubMed понял мой запрос следующим образом:
Induction[All Fields] AND ("pluripotent stem cells"[MeSH Terms] OR ("pluripotent"[All Fields] AND "stem"[All Fields] AND "cells"[All Fields]) OR "pluripotent stem cells"[All Fields]) AND ("mice"[MeSH Terms] OR "mice"[All Fields] OR "mouse"[All Fields]) AND ("embryonic structures"[MeSH Terms] OR ("embryonic"[All Fields] AND "structures"[All Fields]) OR "embryonic structures"[All Fields] OR "embryonic"[All Fields]) AND ("adult"[MeSH Terms] OR "adult"[All Fields]) AND ("fibroblasts"[MeSH Terms] OR "fibroblasts"[All Fields] OR "fibroblast"[All Fields]) AND ("culture"[MeSH Terms] OR "culture"[All Fields] OR "cultures"[All Fields]) AND defined[All Fields] AND factors[All Fields]

Остальные мои запросы приведены в таблице 1.


У статьи "Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors" следующая литературная ссылка и запись MEDLINE.

На данную статью ссылается 2267 работ. Статей с близко тематикой 193. Из них — 14 обзорных и 98 в свободном доступе.


Таблица 1. Поисковые запросы в PubMed
Поисковой запрос Значение поля "Search details" Количество статей
Yamanaka S[AU] AND Cell[TA] Yamanaka S[AU] AND "Cell"[Journal] 7
Yamanaka S[AU] AND 2006[DP] Yamanaka S[AU] AND 2006[DP] 2 (одна на японском)
Yamanaka S[AU] AND 2006[DP] AND pluripotent stem cells[title] AND English[LA] Yamanaka S[AU] AND 2006[DP] AND pluripotent stem cells[title] AND English[LA] 1
Yamanaka S[AU] AND 2006[DP] AND Cell[TA] Yamanaka S[AU] AND 2006[DP] AND "Cell"[Journal] 1

Продолжении работы и исследований.

Для того, чтобы выяснить, какой темой Яманака занимался за два с половиной года до вручения Нобелевской премии, я сделала следующий запрос в PubMed: "Yamanaka S[AU] AND 2010/06 : 2012/09[dp] NOT Review[pt]".

Оказалось, что за это время учёный написал 89 статей, часть из которых действительно была посвящена теме плюрипотентных клеток. В основном работы были о применении индуцированных столовых клеток в медицине и усовершенствовании методов их получения. Также довольно много статей было посвящено стволовым клеткам и генам. Коллекцию со статьями этого учёного можно посмотреть здесь.


Статьи по данной теме.

Для поиска статей со схожей тематикой я использовала поиск по ключевым словам. Поиск по сочетанию "iPS cells" дал 7054 результата, из которых я выбрала 2 статьи; "pluripotent stem" — 13718, откуда я взяла одну статью.

Из 2267 статей, которые ссылаются на данную, я выбрала 2 работы; из 193 статей с близкой тематикой (Related citation) — 3.


Коллекцию с данными статьями можно посмотреть здесь.



Источники:

[1] MLA style: "The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2012". Nobelprize.org. Nobel Media AB 2013. Web. 24 Mar 2014.

[2] MLA style: "The 2012 Nobel Prize in Physiology or Medicine - Advanced Information". Nobelprize.org. Nobel Media AB 2013. Web. 24 Mar 2014.

[3] Briggs R, King TJ (1952). Transplantation of Living Nuclei from Blastula Cells into Enucleated Frog's Eggs. Proc Natl Acad Sci USA 38: 455-463.

[4] Gurdon JB (1962). Developmental Capacity of Nuclei Taken from Intestinal Epithelium Cells of Feeding Tadpoles. J Embryol Exp Morph 10: 622-640.

[5] Takahashi K, Yamanaka S (2006). Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors. Cell 126: 663-676.

Наверх