Поиск сигналов. MEME
Осуществлялся поиск регуляторных мотивов в следующем наборе областей генов E.coli. Также использовался список установленных сайтов связывания белка PurR.
Для этой задачи использовалась программа MEME. Отчёт о выполненной работе представлен в этом документе.
Программа запускалась 2 раза с разными параметрами: "One per sequence" и "Zero or one per sequence". В результате в одном случае экспериментально подтверждённый участок ни попал ни в один, найденный программой. В 9 случаях экспериментально установленные участки и найденные отличались незначительно (1-2 нуклеотида).