На страницу I-ого семестра

Описание вторичной структуры BIOB_Ecoli

Схема вторичной структуры

На рисунке, изображающим вторичную структуру белка BIOB_Ecoli, красными прямоугольниками показаны α-спирали, а желтые стрелочки изображают β-тяжи. На прямоугольниках и стрелочках написаны номера аминокислотных остатков, входящих в соответствующую структуру.

Для определения α-спиралей и β-тяжей использовалась программа RasMol. В этой программе структуру белка изображал в виде cartoons, а затем раскрашивал по структуре (color structure). Потом щелкал мышкой по началным и конечным аминокислотным остаткам спирали, чтобы узнать их номера. Полученные результаты сравнил с данными из pdb-файла (строки Helix и Sheet) - почти все совпало. Привел свои результаты в соответствие с данными из pdb-файла и нарисовал картинку в ворде.

Примечание: вызывает сомнение спираль, обозначенная на рисунке H10. Структура водородных связей в этой спирали наводит на мысль, что это не α-спираль, а 310-спираль. Впрочем, эта идея может быть ошибочной.


© Sedliarov Vitaliy