На страницу II-ого семестра

Белок BIOB_Ecoli в банках Swiss-Prot и TrEMBL

• Информация о белке BIOB_Ecoli в банке Swiss-Prot

Описание поля Метка поля Содержание поля
Код доступа ("Accession number") AC P12996
Идентификатор последовательности в БД ID BIOB_ECOLI
Название (краткое описание) белка DE Biotin synthase (Biotin synthetase)
Дата создания документа DT 1 января 1990 года
Дата последнего исправления аннотации DT 21 февраля 2006 года
Название организма OS Escherichia coli
Полное название таксона OC Bacteria;
Proteobacteria;
Gammaproteobacteria;
Enterobacteriales;
Enterobacteriaceae;
Escherichia
Длина последовательности ID 346 аминокислотных остатков
Молекулярная масса белка SQ 38648 Дальтон
Число публикаций, использованных при создании документа RN 10
Название журнала с самой свежей публикацией RL Science vol. 303:76-79(2004)
Описание вторичной структуры FT Перечисленны α-спирали, β-тяжи и β-петли, указаны номера начальных и конечных аминокислотных остатков
Что содержит поле комментариев? СС Каталитическая активность, кофакторы для данного белка, участие в биосинтезе, принадлежность белка к определенному семейству. Также авторские права на информацию.
Какие особенности последовательности указаны? FT В этой графе полностью описана вторичная структура. В строке с надписью "CONFLICT" указан номер остатка, статья в которой этой остаток указан не верно и правильный вариант.(Например, в статье "The Escherichia coli biotin biosynthetic enzyme sequences predicted from the nucleotide sequence of the bio operon." (Ref. 1) в 63 аминокислотном остатке вместо серина следует читать треонин (S → T)). А также указано, с какими аминокислотными остатками связаны активные центры.
Идентификаторы записей PDB DR 1R30

Запись о белке BIOB_Ecoli в базе Swiss-Prot

• Поиск в базах Swiss-Prot и TrEMBL

Запрос Число документов в SwissProt Число документов в TrEMBL
Biotin synthase 86 479
Biotin synthetase 94 302
EC 2.8.1.6 23 168

© Sedliarov Vitaliy