На страницу II-ого семестра

Мотивы в белке BIOB_Ecoli, описанные в БД Prosite

Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования протеинкиназой С паттерн [ST] - x - [RK] неспецифична 6
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования казеин киназой II паттерн [ST] - x(2) - [DE] неспецифична 6
PS00008 MYRISTYL Сайт N-миристоилирования паттерн G - {EDRKHPFYW} - x(2) - [STAGCN] - {P} неспецифична 6


Коментарии: Поиск мотивов проводили в базе данных Prosite по AC P12996. Страница результатов.

Специфичных подписей в данном белке надено не было, зато было найдено 3 неспецифичные подписи. Найдено было по 6 штук каждого мотива. Но при внимательном рассмотрении паттернов, состоящих всего из 3-х (4-х) позиций, невольно возникает мысль о случайном совпадении. Вполне возможно, что не все найденные мотивы являются соответствующими сайтами.


© Sedliarov Vitaliy