Филогенетические деревья


Задание 1

Отобранные бактерии

Название Мнемоника Таксономия
Aromatoleum aromaticum AROAE Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Rhodocyclales; Rhodocyclaceae; Aromatoleum
Burkholderia cenocepacia BURCA Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Burkholderia; Burkholderia cepacia complex
Neisseria meningitidis NEIMA Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Neisseriales; Neisseriaceae; Neisseria
Polynucleobacter asymbioticus POLAQ Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Polynucleobacter
Pseudomonas mendocina PSEMY Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas; Pseudomonas aeruginosa group
Rhizobium meliloti RHIME Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Sinorhizobium/Ensifer group; Sinorhizobium
Thiobacillus denitrificans THIDA Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Nitrosomonadales; Thiobacillaceae; Thiobacillus
Yersinia pestis YERPE Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Yersiniaceae; Yersinia; Yersinia pseudotuberculosis complex

Дерево


Cкобочная формула

(((YERPE, PSEMY), (NEIMA, ((AROAE, THIDA), (BURCA, POLAQ)))), RHIME)


Нетривиальные ветви

  1. {YERPE, PSEMY} vs. {NEIMA, AROAE, THIDA, BURCA, POLAQ, RHIME}
    соответствует классу Gammaproteobacteria
  2. {NEIMA, AROAE, THIDA, BURCA, POLAQ} vs. {YERPE, PSEMY, RHIME}
    соответствует классу Betaproteobacteria
  3. {AROAE, THIDA, BURCA, POLAQ} vs. {YERPE, PSEMY, RHIME, NEIMA}
    не соответстует никакому таксону по NCBI
  4. {BURCA, POLAQ} vs. {YERPE, PSEMY, RHIME, NEIMA, AROAE, THIDA}
    соответствует порядку Burkholderiales
  5. {AROAE, THIDA} vs. {YERPE, PSEMY, RHIME, NEIMA, BURCA, POLAQ}
    не соответстует никакому таксону по NCBI