|
Для анализа был выбран белок ENO1, енолаза из Saccharomyces cerevisiae. Его PDB код: 2xh2, разрешение структуры 1,8 А. С помощью команды isomesh было построено изображение электронной плотности вокруг цепи А этого белка. ![]() Из рисунка видно, что при уровне подрезки 1 электронная плотность окружает весь белок, а при увеличении уровня - петли на поверхности белка остаются не покрыты. Также было построено изображение электронной плотности для отдельных аминокислот этого белка. ![]() Рис.2 Электронная плотность гистидина (63) с уровнями подрезки 3, 2 и 1. ![]() Рис.3 Электронная плотность лизина (66) с уровнями подрезки 3, 2 и 1. ![]() Рис.4 Электронная плотность аспарагиновой кислоты (70) с уровнями подрезки 3, 2 и 1. При уровне подрезки 1 электронная плотность окружает весь аминокислотный остаток, а при увеличении уровня - остаются покрыты только некоторые атомы, в основном, кислорода. В целом, с помощью карты электронной плотности можно определить положение всех атомов в структуре. |