|
Я выбрала человеческий циклофилин А, для которого есть как РСА (1W8L), так и ЯМР (1OCA) структура. Структуры, полученные разными способами очень похожи. Разрешение РСА структуры 1,8 А. ЯМР содержит 20 моделей. ![]() Рис.1 ЯМР структура– слева, РСА структура – справа. За водородную связь принималось расстояние меньше 3, 5 А. Сравнивались водородные связи в структурах: - водородная связь в бета-листе; - водородная связь между боковыми радикалами в центре белка; - водородные связи в петлях на поверхности белка. Результаты измерений приведены в следующих рисунках и таблице. ![]() ![]() Рис.2 Водородные связи в бета-листе между VAL6(O) и PHE22(N). ![]() Рис.3 Водородные связи в глобуле белка между SER99(O) и HIS92(N). ![]() Рис.4 Водородные связи на поверхности белка между ASP27(O) и ASN3(N). ![]() Рис.5 Водородные связи на поверхности белка между GLU165(O) и THR5(N). Внутри белка водородные связи стабильны. Интересно, что даже на поверхности нашлась прочная водородная связь, которая сохраняется, несмотря на подвижность петли. ![]() |