Анализ молекулярной поверхности

Седьмой семестр Главная страница

Для структуры шаперона (5owl), полученной методом ЯМР построена поверхность молекулы (рис.1), для каждой из 10 моделей подсчитана площадь поверхности и площадь, доступная для растворителя (табл.1). Рис. 1 Поверхность молекулы. Таблица 1 Наблюдается очень слабая положительная корреляция площади поверхности от площади поверхности, доступной для растворителя (рис.2). Это ожидаемо, так как, в целом, при увеличении общей площади будет увеличиваться также площадь, доступная для растворителя. Рис.2 Зависимость общей площади поверхности от площади поверхности, доступной для растворителя. Также для молекулы были построены поверхности в местах контактов (расстояние менее 3,5 А) цепей (рис.3, рис.4). Рис.3 Остатки, расположенные в месте контакта цепей. Рис.4 Молекулярная поверхность в месте контакта цепей.