На главную страницу первого семестра TRUB_ECOLI

тРНК-псевдоуридинсинтетаза

Краткое название белка — TRUB_ECOLI
Полное название организма — Escherichia coli , K-12
Название гена — "truB"
Номер локуса в бактериальной хромосоме — b3166
Последовательность в формате FASTA:

>TRUB ECOLI
MSRPRRRGRDINGVLLLDKPQGMSSNDALQKVKRIYNANRAGHTGALDPLATGMLPICLGEATKFSQYLLDSDKRYRVI
ARLGQRTDTSDADGQIVEERPVTFSAEQLAAALDTFRGDIEQIPSMYSALKYQGKKLYEYARQGIEVPREARPITVYEL
LFIRHEGNELELEIHCSKGTYIRTIIDDLGEKLGCGAHVIYLRRLAVSKYPVERMVTLEHLRELVEQAEQQDIPAAELL
DPLLMPMDSPASDYPVVNLPLTSSVYFKNGNPVRTSGAPLEGLVRVTEGENGKFIGMGEIDDEGRVAPRRLVVEYPA

Мои вычисления с помощью Excel

Аминокислотный состав белка:

A(Аланин)	7,72%
C(Цистеин)	0%
D(Аспарагиновая кислота)	6,11%
E(Глутаминовая кислота)	8,36%
F(Фенилаланин)	1,93%
G(Глицин)	8,04%
H(Гистидин)	1,61%
I(Изолейцин)	5,79%
K(Лизин)	4,18%
L(Лейцин)	11,25%
M(Метионин)	2,57%
N(Аспарагин)	2,89%
P(Пролин)	6,11%
Q(Глутамин)	3,86%
R(Аргинин)	8,68%
S(Серин)	5,14%
T(Треонин)	4,5%
V(Валин)	6,75%
W(Триптофан)	0%
Y(Тирозин)	4,5%

Длина последовательности — 311 а.о.
Молярная масса — 40362,38 г/моль
Средний заряд молекулы при рН=7.0 — -4,31
Отношение содержания гидрофобных остатков:

Аланин, цистеин, фенилаланин, изолейцин, лейцин, метионин, валин

к содержанию гидрофильных

Аспарагин, глутамин, гистидин, лизин, аспарагиновая кислота, глутаминовая кислота, аргинин, серин

— 0,88, что позволяет думать, что данный белок не является мембранным.

На главную страницу первого семестра