На главную страницу второго семестра Матрицы весов аминокислотных замен

Множественное выравнивание блока из базы данных BLOCKS, отвечающего белку TRUB_ECOLI

                                                                                                                                   
                                            *                 2 0                   *                 4 0                          
C B F 5 _ A S P F U   :   L D K P S N P S S H E V V A W M K R I L R A E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I D R A T R   :   4 8
C B F 5 _ C A N A L   :   L D K P S N P S S H E V V A W I K R I L R V E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I D R A T R   :   4 8
C B F 5 _ E M E N I   :   L D K P S N P S S H E V V A W M K R I L R A E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I D R A T R   :   4 8
C B F 5 _ K L U L A   :   L D K P S N P S S H E V V A W I K R I L R C E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C V D R A T R   :   4 8
C B F 5 _ S C H P O   :   L D K P A N P S S H E V V A W V K K I L R V E K T G H S G T L D P K V T G C L I I C N D R A T R   :   4 8
C B F 5 _ Y E A S T   :   L D K P S N P S S H E V V A W I K R I L R C E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I D R A T R   :   4 8
D K C 1 _ H U M A N   :   L D K P S N P S S H E V V A W I R R I L R V E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I E R A T R   :   4 8
D K C 1 _ M O U S E   :   L D K P S N P S S H E V V A W I R R I L R V E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I E R A T R   :   4 8
D K C 1 _ R A T | P   :   L D K P S N P S S H E V V A W I R R I L R V E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I E R A T R   :   4 8
N O 5 0 _ C A E E L   :   L D K P S N P S S H E V V S W I K R I L R C E K T G H S G T L D P K V S G C L I V C I D R T T R   :   4 8
N O 6 0 _ D R O M E   :   L D K P S N P S S H E V V A W I K K I L K V E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I D R A T R   :   4 8
O 3 2 7 8 5 | 7       :   V Y K E A G W T S F D V V A K L R G I L K T K K I G H G G T L D P Q V T G V L P V A V G K A T R   :   4 8
O 9 5 9 0 0 | 6 7     :   L T A T S V P S F I N H P L V C G P A F A H L K V G V G H R L D A Q A S G V L V L G V G H G C R   :   4 8
P U S 4 _ S C H P O   :   R P A P P H P N D R N R R R R K S N R L P D I K I G H G G T L D P L A S G V L V V G L G T G T K   :   4 8
P U S 4 _ Y E A S T   :   K Q Q Y E K Q T G K K A S K R K L R K V S K V K M G H G G T L D P L A S G V L V I G I G A G T K   :   4 8
Q 5 W F U 5 | 9       :   L D K P K G W T S H D C V H Q M R K W F Q T R K V G H T G T L D P E V D G V L P I C I G K A T K   :   4 8
Q 5 W T 3 8 | 1 6     :   L N K P Q G M T S N A A L Q K A K H L F G A K K A G H T G S L D P L A T G M L P L C F G E A T K   :   4 8
Q 5 X 1 C 5 | 1 6     :   L N K P Q G M T S N A A L Q K A K H L F G A K K A G H T G S L D P L A T G M L P L C F G E A T K   :   4 8
Q 5 X B X 7 | 8       :   L K K E A G M T S H D A V F K L R K L L Q E K K I G H G G T L D P D V V G V L P I A V G K A T R   :   4 8
Q 5 X F W 2 | 6 7     :   L T A T S V P S L T T H R L V R G P A F R N L K I G V G H R L D V Q A S G V L V L A V G H G R S   :   4 8
Q 5 Y S E 0 | 2 0     :   V D K D G G M T S H D V V A R C R K I L G T R K I G H A G T L D P M A T G V L V L G V E R A T K   :   4 8
Q 5 Z J H 9 | 9 2     :   L D K P S N P S S H E V V A W I R R I L R V E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I E R A T R   :   4 8
Q 5 Z R V 6 | 2 1     :   L N K P Q G M T S N A A L Q K T K H L F G A K K A G H T G S L D P L A T G M L P L C F G E A T K   :   4 8
Q 6 0 1 U 7 | 5 2     :   L Y K P K K I S S A K F L R Q W S K T N L I K K A G H A G T L D P L A S G L L L V A T E D D T K   :   4 8
Q 6 0 9 C 2 | 1 5     :   L D K G S G M T S N S A L Q R A R K L L D M R K A G H T G S L D P L A S G I L P L C F N E A T K   :   4 8
Q 6 0 Y A 8 | 8 2     :   L D K P S N P S S H E V V S W I K R I L R C E K T G H S G T L D P K V S G C L I V C I D R T T R   :   4 8
Q 6 2 K L 1 | 2 1     :   L D K P V G L S S N D A L M R A K R L Y Q A K K A G H T G T L D P L A S G L L P L C F G E A T K   :   4 8
Q 6 2 U Y 3 | 8       :   L H K P V G M T S H D C V M K I R K L L K T K K V G H T G T L D P E V S G V L P I C V G R A T K   :   4 8
Q 6 3 6 L 6 | 7       :   L H K P K G M T S H D C V F K L R K I L R E K R I G H T G T L D P D V T G V L P I C V G R A T K   :   4 8
Q 6 3 T Q 0 | 2 1     :   L D K P V G L S S N D A L M R A K R L Y Q A K K A G H T G T L D P L A S G L L P L C F G E A T K   :   4 8
Q 6 5 0 L 8 | 1 7     :   W T S F K V V G H A R Y H M C R R M K V K K L K V G H A G T L D P L A T G V M I V C T G K A T K   :   4 8
Q 6 5 J H 8 | 8       :   L H K P V G M T S H D C V M K I R K L L K T K K V G H T G T L D P E V S G V L P I C V G R A T K   :   4 8
Q 6 5 S L 2 | 1 7     :   L D K P Q G M S S N D I L Q K V K R I Y Q A N K A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
Q 6 5 X 2 5 | 2 7 4   :   I D K P K G W T S F T V C G K L R R L V N V Q K V G H A G T L D P M A T G L L I V C V G K A T K   :   4 8
Q 6 5 Z X 0 | 8       :   I N K E Q G K T S F E T L F P I K K Y F N T N H V G H A G T L D K F A S G I L I A L V G K Y T K   :   4 8
Q 6 6 F 5 8 | 1 7     :   L D K P L G L S S N D V L Q K V K R L F S A N R A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
Q 6 7 P 8 3 | 1 8     :   L L K P P G M T S H D V V A F V R R A L G V K K A G H T G T L D P G V A G V L P V C V G R A T R   :   4 8
Q 6 8 W N 3 | 8       :   F Y K P K G I S S A K L V N I V K K I I G K T K I G H A G T L D V E A E G I L P L A V G E A T K   :   4 8
Q 6 B I D 3 | 6 3     :   L D K P S N P S S H E V V A W I K R I L R S E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I D R A T R   :   4 8
Q 6 B P N 6 | 4 5     :   Q A L G T D K K W S K E R I N K R V K S L K V K I G H G G T L D P M A S G V L V V G V G L G T K   :   4 8
Q 6 C 6 0 9 | 6 9     :   L D K P S N P S S H E V V A W I K R I L R C E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I D R A T R   :   4 8
Q 6 C 7 U 6 | 2 3     :   E K L K W T F I N A A G G K Q K G G S R N P L K I G H G G A L D P F A T G V L A I G V G A G T K   :   4 8
Q 6 C N E 6 | 4 4     :   S Q Q Y A K E T G K K P S K R K L R K V S Q I K M G H G G T L D P L A S G V M V I G I G S G T K   :   4 8
Q 6 F J U 1 | 4 4     :   R K Q F E Q Q T G K K A S K R K L R K V S K V K M G H G G T L D P L A S G V L V L G V G T G T K   :   4 8
Q 6 F S 4 0 | 6 3     :   L D K P S N P S S H E V V A W I K R I L R C E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I D R A T R   :   4 8
Q 6 G M H 2 | 6 0     :   L S P S M V P S L A D H P L V T G P Q F H K V H V G V G H R L D A F S S G V L V L G V G K G N S   :   4 8
Q 6 K H H 8 | 7       :   L R K T K N I S S F N F I N N F K K T K G F K K I G H C G T L D P L A T G L L I V A T D E D T K   :   4 8
Q 6 L 1 A 0 | 1 0     :   V D K P K G P T S H Q I D S W I R D I T G E P R V G H I G T L D P G V S G V L V M A L G K A T K   :   4 8
Q 6 L W M 3 | 3 5     :   I D K P S G P T S H E V A A W V R N M L N L V K A G H G G T L D P K V T G A L P V A L G N T T K   :   4 8
Q 7 2 N X 5 | - 5     :   X X X X X X M T S S D L V V T V R K K L G F K K V G H T G T L D R A A S G L M I L P I G S C T S   :   4 8
Q 7 5 8 G 0 | 4 4     :   A M Q Y Q K E T G R K P S K H K L R K V S Q I K M G H G G T L D P L A S G V M I V G I G T G T K   :   4 8
Q 7 5 E U 2 | 6 3     :   L D K P S N P S S H E V V A W I K R I L R C E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I D R A T R   :   4 8
Q 7 L W Y 0 | 5 1     :   L D K P P G P T S H E V V A W I K K I L N L E K A G H G G T L D P K V S G V L P V A L E K A T R   :   4 8
Q 7 P 2 Z 2 | 7       :   V N K P K G I T S F D V I R K L K K I L K T K K I G H T G T L D P L A T G V M L V C V G K A T K   :   4 8
Q 7 P 3 B 4 | 8       :   I Y K P R G I S S A Q L V S I V K K I L G K T K I G H A G T L D V E A E G I L P F A V G E A T K   :   4 8
Q 7 P M U 4 | 7 9     :   L D K P S N P S S H E V V A W I K R I L K V N K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I N R A T R   :   4 8
Q 7 Q R 2 4 | 5 4     :   L D K T A G P S S H E V V A W I R R I L E V E K T G H S G T L D P G V T G C L L V C L D R A T R   :   4 8
Q 7 R D H 5 | 3 8 4   :   L D K P S N P S S H E V V S W I R K I L R C E K T G H S G T L D P K V T G V L L V C L N R A T R   :   4 8
Q 7 T 0 1 3 | 7 1     :   L S P S M V P S L A D H P L V T G P Q F H K V H V G V G H R L D A F S S G V L V L G V G K G N S   :   4 8
Q 7 T Q K 3 | 2 9     :   V A A S V A E A G M P S P E W N K R Q K Q T L K V G H G G T L D S A A Q G V L V V G I G R G T K   :   4 8
Q 7 Z U T 3 | 8 9     :   L D K P A N P S S H E V V A W I K R I L R V E K T G H S G T L D P K V T G C L I V Y V E R A T R   :   4 8
Q 8 4 Z W 4 | 2 7 4   :   I D K P K G W T S F T V C G K L R R L V N V Q K V G H A G T L D P M A T G L L I V C V G K A T K   :   4 8
Q 8 6 Z H 4 | 6 5     :   L D K P S N P S S H E V V A W I K R M L R V E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C V D R A T R   :   4 8
Q 8 B T K 3 | 6 7     :   L R A T N V P S L T T H R L V R G P A F T N L K I G V G H R L D V Q A S G V L V L A V G H G R S   :   4 8
Q 8 C 0 D 0 | 7 8     :   K E K L L A E A G M P S P E W N K R Q K Q T L K V G H G G T L D S A A Q G V L V V G I G R G T K   :   4 8
Q 8 C X 1 1 | 8       :   L K K E A G M T S H D A V F K L R K I L H T K K I G H G G T L D P D V V G V L P I A V G K A T R   :   4 8
Q 8 E 5 J 6 | 8       :   L K K E A G M T S H D A V F K L R K I L H T K K I G H G G T L D P D V V G V L P I A V G K A T R   :   4 8
Q 8 H 5 T 5 | 1 0 8   :   L D K P S N P S S H E V V A W I K R L L R V D K T G H S G T L D P K V T G N L I V C V D R A T R   :   4 8
Q 8 I 7 1 5 | 3 4 2   :   V C E K I K K I L K D Y F Y K L N K K K V N I K V G H G G T L D P F A E G V L I I G I Q Q A T K   :   4 8
Q 8 I L S 0 | 6 6     :   L D K P S N P S S H E V V S W I R K I L R C E K T G H S G T L D P K V T G V L L V C L N R A T R   :   4 8
Q 8 S R W 0 | 6 2     :   V D K S P N P S S H E V V T W V K E I L K C E K T G H S G T L D P Q V S G V L T I C I D R A T R   :   4 8
Q 8 T 4 0 8 | 9 2     :   L D K P S N P S S H E V V A W I K K I L K V E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I D R A T R   :   4 8
Q 8 W W H 5 | 9 0     :   K E K L L A E A G M P S P E W T K R K K Q T L K I G H G G T L D S A A R G V L V V G I G S G T K   :   4 8
Q 9 1 W G 3 | 6 7     :   L R A T N V P S L T T H R L V R G P A F T N L K I G V G H R L D V Q A S G V L V L A V G H G R S   :   4 8
Q 9 4 H L 3 | 3 1 1   :   I D K P K G W T S F T V C G K L R R L V N V Q K V G H A G T L D P M A T G L L I V C V G K A T K   :   4 8
Q 9 9 U K 1 | 8       :   V Y K E R G L T S H D V V F K L R K I L K T K K I G H T G T L D P E V A G V L P V C I G N A T R   :   4 8
Q 9 9 Z F 5 | 8       :   L K K E A G M T S H D A V F K L R K L L Q E K K I G H G G T L D P D V V G V L P I A V G K A T R   :   4 8
Q 9 C 2 G 0 | 4 7     :   A L R E K E G R Y Q K Q R R T H A K R E I N V K I G H G G T L D P L A T G V L I L G V G K G T K   :   4 8
Q 9 F R C 6 | 1 1 2   :   L D K P S N P S S H E V V A W I K R L L R V E K T G H S G T L D P K V T G N L I V C V D R A T R   :   4 8
Q 9 L D 9 0 | 8 5     :   L D K P A N P S S H E V V A W I K R I L R V E K T G H S G T L D P K V T G N L I V C I D R A T R   :   4 8
Q 9 L L 8 2 | 7 0     :   L D K P S N P S S H E V V S W L K R I L K V E K T G H A G T L D P K V T G S L L I C I E R A T R   :   4 8
Q 9 L Y 8 3 | 3 2 6   :   V N K P K G W T S F T V C G K L R R L V K V K K V G H A G T L D P M A T G L L I V C V G K A T K   :   4 8
Q 9 M 3 X 0 | 1 0 7   :   L D K P S N P S S H E V V A W I K R L L R V E K T G H S G T L D P K V T G N L I V C V D R A T R   :   4 8
Q 9 N E 8 5 | 7 5     :   M D K P S N P S S H E V V S W I K R I L K C D K T G H A G T L D P K V T G A L I I C T D R A T R   :   4 8
Q 9 U A N 8 | 9 2     :   L D K P S N P S S H E V V A W I K K I L K V E K T G H S G T L D P K V T G C L I V C I D R A T R   :   4 8
T R U B _ A C I A D   :   L N K P L G L S S N G V L Q K V R W L F R A Q K A G H T G A L D P L A T G L L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ A E R P E   :   X M D Q E D A G S L Q G G P R G D P R A P A S P Q G A A G R G Y P K V T G V L P V A L E R M T R   :   4 8
T R U B _ A G R T 5   :   L D K P L D F G S T E A V S K I K W L F N A Q K A G H A G T L D P L A S G M L P I A L G D A T K   :   4 8
T R U B _ A N A S P   :   L N K Q F G W T S H D C V A R L R K M L R L K R V G H A G T L D P A A T G V L P I A V G K A T R   :   4 8
T R U B _ A Q U A E   :   I D K P K G I T S T E V V E R V K E K L K A R K A G H T G T L D P I A T G L L I I L I N K A T R   :   4 8
T R U B _ A R C F U   :   I D K P M G P S S H E V V V W V R R I L N V S K T G H A G T L D P R V T G V L P I F I E N A T K   :   4 8
T R U B _ B A C A N   :   L H K P K G M T S H D C V F K L R K I L R E K R I G H T G T L D P D V T G V L P I C V G R A T K   :   4 8
T R U B _ B A C C 1   :   L H K P K G M T S H D C I F K L R K I L R E K R I G H T G T L D P D V T G V L P I C V G R A T K   :   4 8
T R U B _ B A C C R   :   L H K P K G M T S H D C V F K L R K I L R E K R I G H T G T L D P D V T G V L P I C V G R A T K   :   4 8
T R U B _ B A C H D   :   L A K P R G M T S H D C V A K L R R L L K T K K V G H T G T L D P D V Y G V L P V C I G H A T K   :   4 8
T R U B _ B A C H K   :   L H K P K G M T S H D C V F K L R K I L R E K R I G H T G T L D P D V T G V L P I C V G R A T K   :   4 8
T R U B _ B A C S U   :   L H K P V G M T S H D C V M K I R K L L K T K K V G H T G T L D P E V S G V L P I C V G R A T K   :   4 8
T R U B _ B A C T N   :   W T S F K V V G H V R Y H I C R R I G V K K L K V G H A G T L D P L A T G V M I L C T G K A T K   :   4 8
T R U B _ B A R H E   :   L D K P K G M R S T E A V S Q I K Y L F H A Q K V G H A G T L D P L A S G L L P I A L G E A T K   :   4 8
T R U B _ B A R Q U   :   F D K P K G M R S T E A V S Q I K W L F H A Q K A G H A G T L D P L A S G L L P I A L G E A T K   :   4 8
T R U B _ B D E B A   :   V D K P S G I S S H D V V A R L R R I L S T R A V G H S G T L D P M A S G L M A C L V N E G T K   :   4 8
T R U B _ B I F L O   :   I D K P Q G V T S F D A V A A V R G A L H I K K V G H A G T L D P M A T G T L V I A F G H A T R   :   4 8
T R U B _ B O R B R   :   L D K P V G L S S N H A L Q R A K R T V D A A K A G H T G T L D P F A T G L L V C C M G R A T K   :   4 8
T R U B _ B O R B U   :   I N K E Q G K T S F E T L F P I K K Y F N T N R V G H A G T L D K F A S G I L V C L V G K Y T K   :   4 8
T R U B _ B O R P A   :   L D K P V G L S S N H A L Q R A K R T V D A A K A G H T G T L D P F A T G L L V C C M G R A T K   :   4 8
T R U B _ B O R P E   :   L D K P V G L S S N H A L Q R A K R T V D A A K A G H T G T L D P F A T G L L V C C M G R A T K   :   4 8
T R U B _ B R A J A   :   L D K P I G M T S T Q A V A V L K R L F N A K R A G H A G T L D P L A S G G L P I A L G E A T K   :   4 8
T R U B _ B R U M E   :   F D K P K G M G S T E A V S K I K W L F S A E K A G H A G T L D P L A S G M L P I A L G E A T K   :   4 8
T R U B _ B R U S U   :   F D K P K G M G S T E A V S K I K W L F S A E K A G H A G T L D P L A S G M L P I A L G E A T K   :   4 8
T R U B _ B U C A I   :   L D K P Q G I S S N N A L Q K V K M L F S A K K A G Y I G T L D P L A T G M L P I C F G E C S K   :   4 8
T R U B _ B U C A P   :   L D K P K G M T S N N V L Q K V K I I F K A K K A G Y I G T L D P L A T G I L P I C F G E A T K   :   4 8
T R U B _ B U C B P   :   I D K P Y G L S S H E T L Q K V K G I L K I K K M G H T G T L D P L A T G M L P M C C G R A T K   :   4 8
T R U B _ C A M J E   :   A F K P R G L S S N A F L S T L K K K Y K N K K A G Y S G T L D P F A K G V L I V A F G Q Y T K   :   4 8
T R U B _ C A N B F   :   L D K P T G F S S S F F L N K I K K L F Y A K K V G Y I G T L D P I A T G M L P I C F G K A T K   :   4 8
T R U B _ C A U C R   :   L D K P Y D L T S T T A V S R V R R A F N A Q K G G H A G T L D P L A T G I L P I A L G E A T K   :   4 8
T R U B _ C H L M U   :   V D K P Q G R T S F S L I R S L V R L I G V K K I G H A G T L D P F A T G V M V M L I G R K F T   :   4 8
T R U B _ C H L P N   :   V D K P Q G R T S F S L I R A L T K L I G V K K I G H A G T L D P F A T G V M V M L I G R K F T   :   4 8
T R U B _ C H L T E   :   L D W T S F D V V A K I R G A Y K R N G A K R K V G H C G T L D P K A T G L L I L A T G R K T K   :   4 8
T R U B _ C H L T R   :   V D K P Q G R T S F S L I R S L V R L I G V K K I G H A G T L D P F A T G V M V M L I G R K F T   :   4 8
T R U B _ C H R V O   :   I D K P Y D I S S N N A L Q K A R W L L N A A K A G H T G V L D P L A T G L L P V C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ C L O A B   :   I F K P I G L T S F D V V R Q V K K I S K E K K V G H T G T L D P L A S G V L P I C I G K A T K   :   4 8
T R U B _ C L O P E   :   I Y K N T G M T S F D V V A M V R R V A K M K K V G H T G T L D P A A S G V L P V C L G K A T K   :   4 8
T R U B _ C L O T E   :   V Y K P Q N I T S F D V V R I I K K I S R I K K V G H T G T L D P M A T G V L P I C L G G S T K   :   4 8
T R U B _ C O R D I   :   V D K P Q G M T S H D V V S K I R R T F S T K K V G H A G T L D P M A T G V L V L G L E R G T K   :   4 8
T R U B _ C O R E F   :   V D K P A G M T S H D V V S K L R R A F S T R K V G H A G T L D P M A T G V L V V G I E R G T R   :   4 8
T R U B _ C O R G L   :   V D K P A G M T S H D V V S K L R R A F S T R K V G H A G T L D P M A T G V L V V G I E R G T R   :   4 8
T R U B _ C Y T J O   :   S S F Q A V N K L K Y L L I N K V G L P K K F K I G H A G T L D P L A T G L L L I C T G K F T K   :   4 8
T R U B _ D E I R A   :   A D K P L H L T S H D V V N R A R R A L G T K R V G H T G T L D P L A T G V V V L C V D D S T K   :   4 8
T R U B _ D E S P S   :   I D K P V G I T S F G V V S R V R R I L G M K K V G H A G T L D P F A T G L L V V C A G R P A T   :   4 8
T R U B _ D E S V H   :   V L D K P S G P S S A Q C I S K V K R L G Q K K I G H A G T L D P M A G G V L L V L L G H A T K   :   4 8
T R U B _ E C O 5 7   :   L D K P Q G M S S N D A L Q K V K R I Y N A N R A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ E C O L 6   :   L D K P Q G M S S N D A L Q K V K R I Y N A N R A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ E C O L I   :   L D K P Q G M S S N D A L Q K V K R I Y N A N R A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ E R W C T   :   L D K P Q G V S S N D V L Q K V K R I F N A N R A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ F U S N N   :   I N K P K G I T S F D V I R K L K K F L K T K K I G H T G T L D P L A I G V M L V C V G K A T K   :   4 8
T R U B _ G E O S L   :   I D K P I G L T S H D V V A R V R Q T L R Q K K A G H T G T L D P F A T G V L P V A V G E G T K   :   4 8
T R U B _ G L O V I   :   L D K P A G L T S H D C I A R L R R V L G E R R I G H G G T L D P A A T G V L P V A V G R A T R   :   4 8
T R U B _ H A E D U   :   L D K P Q G M S S N E V L Q K V K R F Y Q A N K A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ H A E I N   :   L D K P Q G M S S N D I M Q K V K R L F Q A N K A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ H A L N 1   :   L D K P P G P S A H Q V S A W I R D L V G V E K A A H A G T L D P K V T G C L P V L T G T A T R   :   4 8
T R U B _ H E L H P   :   A Y K P P F L S S N A C L S R L K K H F G M S K A G Y L G T L D P F A K G V L V V G F G S Y T R   :   4 8
T R U B _ H E L M O   :   I L K P P G M T S H D V V A K A R R I L R E K R I G H M G T L D P D A A G V L P I A L G Q A T R   :   4 8
T R U B _ L A C J O   :   V N K P R G V T S S D C V Y K L R K I L Q I R K I G H A G T L D P E V N G V L P I A I G Q A T K   :   4 8
T R U B _ L A C L A   :   V Y K E A G W T S F D V V A K L R G I L K T K K I G H G G T L D P S V T G V L P V A V G K S T R   :   4 8
T R U B _ L A C P L   :   L Y K P R G M T S F D C V A K I R R L Y Q T R K V G H S G T L D P N V D G V L P I C I G N A T K   :   4 8
T R U B _ L E I X X   :   I D K P G G W T S H D V V A R V R R L A G T R K V G H A G T L D P M A T G L L V L G L N S S T R   :   4 8
T R U B _ L E P I N   :   X X X X X X M T S S D L V V T V R K K L G F K K V G H T G T L D R A A S G L M I L P I G S C T S   :   4 8
T R U B _ L I S I N   :   L W K E R G M T S H D C V F K L R K I L H T K K V G H T G T L D P E V E G V L P I C I G R A T K   :   4 8
T R U B _ L I S M F   :   L W K E R G M T S H D C V F K L R K I L H T K K V G H T G T L D P E V E G V L P I C I G R A T K   :   4 8
T R U B _ L I S M O   :   L W K E R G M T S H D C V Y K L R K I L H T K K V G H T G T L D P E V E G V L P I C I G R A T K   :   4 8
T R U B _ M E S F L   :   L N K P K G L T T N H L I Q K L K R K L N V K K I G H A G T L D P L A T G V V I C L I N N G T K   :   4 8
T R U B _ M E T A C   :   I D K P S G P T S H E V A A W V K A I L G V N T A G H A G S L D P K V T G L L P T L L G K A T K   :   4 8
T R U B _ M E T J A   :   V D K P R G P T S H E V S T W V K K I L N L D K A G H G G T L D P K V T G V L P V A L E R A T K   :   4 8
T R U B _ M E T K A   :   L D K P A G P T S H E V V A W V K E I F G L S K A G H G G T L D P K V T G V L P I A L E K A T K   :   4 8
T R U B _ M E T M A   :   I D K P R G P T S H E V A A W V K A I L G V H T A G H A G S L D P K V T G L L P T L L G K A T L   :   4 8
T R U B _ M E T T H   :   L D K P S G P T S H Q V D S W V R D M L H V E K V G H G G T L D P K V T G V L P L G I D R A T R   :   4 8
T R U B _ M Y C B O   :   I D K P A G M T S H D V V G R C R R I F A T R R V G H A G T L D P M A T G V L V I G I E R A T K   :   4 8
T R U B _ M Y C G A   :   I D K P K N I S S A F C L N L F K K R F N I K K A G H N G T L D P L A S G V L V V A T N K R T K   :   4 8
T R U B _ M Y C L E   :   I D K P S G M T S H D V V A R C R R I F C T R R V G H A G T L D P M A T G V L V L G V D R A T K   :   4 8
T R U B _ M Y C M S   :   L N K P S N I S T Y Q L I N Q V K K K L N I K K V G H C G T L D L L A T G V V I C L V N N A T K   :   4 8
T R U B _ M Y C P A   :   V D K P A G M T S H D V V G R C R R I F A T R R V G H A G T L D P M A T G V L V L G V E R A T K   :   4 8
T R U B _ M Y C P E   :   I N K P K N F S S N Q V I Q I I K K Y Y G L K K I G H A G T L D P L A T G L L L V A T N S K T K   :   4 8
T R U B _ M Y C P U   :   I Y K E K G I S S F K A I K D F A W Q N N I K K I G H S G T L D P E A T G L L L L A S D E D T K   :   4 8
T R U B _ M Y C T U   :   I D K P A G M T S H D V V G R C R R I F A T R R V G H A G T L D P M A T G V L V I G I E R A T K   :   4 8
T R U B _ N A N E Q   :   N L D K P S G P T S H Q V V A W V R D I V G V K A G H G G T L D P K V T G V L P I A I G E A T K   :   4 8
T R U B _ N E I M A   :   L D K P E G L S S N T A L Q K T R H L F R A E K A G H T G V L D P L A T G L L P V C F G E A T K   :   4 8
T R U B _ N E I M B   :   L D K P E G L S S N T A L Q K A R R L F H A E K A G H T G V L D P L A T G L L P V C F G E A T K   :   4 8
T R U B _ N I T E U   :   L N K P S G I S S N R A L Q I S K R L L S A A K A G H T G T L D P M A Q G L L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ O C E I H   :   L W K P K G L T S H D C V M R C R R Y F K T K K V G H T G T L D P E V E G V L P I C I G Q A T K   :   4 8
T R U B _ O N Y P E   :   V N K P E K M T S H D V V F Q I K K K F H F D K V G H T G T L D P L A S G L L I I C V G K A T K   :   4 8
T R U B _ P A R U W   :   I N K P K G K T S F S L V R D L R K R L G V K K I G H A G T L D P F A T G V M V M L V G R N Y T   :   4 8
T R U B _ P A S M U   :   L D K P Q G M S S N D I M Q K V K R V F Q A N K A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ P H O L L   :   L D K P Q D I S S N D A L Q K V K R I F N A S K A G H T G A L D P L A T G M L P V C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ P H O P R   :   L D K P T G I T S N D T L Q K V K R I F F A Q K A G H T G A L D P L A T G M L P I C F G E A T K   :   4 8
T R U B _ P R O A C   :   V D K P A G V T S H Q V V G R V R R L M G T R K V G H A G T L D P M A S G V L V V G V N R A T R   :   4 8
T R U B _ P R O M A   :   I N K P A G L T S H D C V N R L R R I Y G I K R I G H G G T L D P A V T G V L P I A I G K A T R   :   4 8
T R U B _ P R O M M   :   I D K P A G I T S H D C V S R M R R V F G I K R V G H G G T L D P A V T G V L P I A L G H A T R   :   4 8
T R U B _ P R O M P   :   I N K E K G F T S H D C V K Q I R K L L G I K K V G H T G T L D P D V T G T L P I A I G S A T R   :   4 8
T R U B _ P S E A E   :   L D K P R G M S S N Q A L Q K V R W L L N A E K A G H T G S L D P L A T G V L P L C F G E A T K   :   4 8
T R U B _ P Y R A B   :   L D K P P G P T S H E V V A W I K R I L N L E K A G H G G T L D P K V S G V L P V A L E R A T R   :   4 8
T R U B _ P Y R A E   :   L D K P R G P S S H E V A A W V K K I L G V E R A G H A G T L D P K V S G V L P I A I A E G T K   :   4 8
T R U B _ P Y R H O   :   L D K P P G P T S H E V V A W I K R I L N L E K A G H G G T L D P K V S G V L P V A L E K A T R   :   4 8
T R U B _ R A L S O   :   L D K P I G W S S N D A L I R A K R L L W A K K A G H T G T L D P L A T G L L P L C F G E A T K   :   4 8
T R U B _ R H I L O   :   L D K P V G M G S T E A V S K I K W L F Q A E K A G H A G T L D P L A S G M L P I A L G E A T K   :   4 8
T R U B _ R H I M E   :   L D K P L D F G S T E A V S K I K W L F K A Q K A G H A G T L D P L A S G M L P I A L G D A T K   :   4 8
T R U B _ R H O B A   :   A T S R D L V N R A Q R R L R G E F G L R K L K V G H T G T L D P L A E G L V L L A I G S A A R   :   4 8
T R U B _ R H O P A   :   L D K P I G M T S T Q A V A V L K R L F S A K R A G H A G T L D P L A S G G L P I A M G E A T K   :   4 8
T R U B _ R I C C N   :   I Y K P R G I S S A Q L V S I V K K I L G K T K I G H A G T L D V E A E G I L P F A V G E A T K   :   4 8
T R U B _ R I C P R   :   F Y K P R G I S S A K L V N I V K K I I G K T K I G H A G T L D V E A E G I L P L A V G E A T K   :   4 8
T R U B _ S A L T I   :   L D K P Q G M S S N D V L Q K V K R I Y N A N R A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ S A L T Y   :   L D K P Q G M S S N D V L Q K V K R I Y N A N R A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ S H I F L   :   L D K P Q G M S S N D A L Q K V K R I Y N A N R A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ S T A A M   :   V Y K E R G L T S H D V V F K L R K I L K T K K I G H T G T L D P E V A G V L P V C I G N A T R   :   4 8
T R U B _ S T A A N   :   V Y K E R G L T S H D V V F K L R K I L K T K K I G H T G T L D P E V A G V L P V C I G N A T R   :   4 8
T R U B _ S T A A R   :   V Y K E R G L T S H D V V F K L R K I L K T K K I G H T G T L D P E V A G V L P V C I G N A T R   :   4 8
T R U B _ S T A A S   :   V Y K E R G L T S H D V V F K L R K I L K T K K I G H T G T L D P E V A G V L P V C I G N A T R   :   4 8
T R U B _ S T A A W   :   V Y K E R G L T S H D V V F K L R K I L K T K K I G H T G T L D P E V A G V L P V C I G N A T R   :   4 8
T R U B _ S T A E P   :   V F K E R G L T S H D V V F K L R K I L K M K K I G H T G T L D P E V N G V L P I C L G D A T K   :   4 8
T R U B _ S T R A 3   :   L K K E A G M T S H D A V F K L R K I L H T K K I G H G G T L D P D V V G V L P I A V G K A T R   :   4 8
T R U B _ S T R A 5   :   L K K E A G M T S H D A V F K L R K I L H T K K I G H G G T L D P D V V G V L P I A V G K A T R   :   4 8
T R U B _ S T R A W   :   V D K P S G F T S H D V V A K M R G I A R T R R V G H A G T L D P M A T G V L V L G V E K A T K   :   4 8
T R U B _ S T R C O   :   V D K P S G F T S H D V V A K M R G I A R T R R V G H A G T L D P M A T G V L V L G V E R A T K   :   4 8
T R U B _ S T R M U   :   L K K E A G M T S H D A V F K L R K I L K E K K I G H G G T L D P D V I G V L P I A V G K A T R   :   4 8
T R U B _ S T R P 3   :   X X X X X X M T S H D A V F K L R K L L Q E K K I G H G G T L D P D V V G V L P I A V G K A T R   :   4 8
T R U B _ S T R P 8   :   L K K E A G M T S H D A V F K L R K L L Q E K K I G H G G T L D P D V V G V L P I A V G K A T R   :   4 8
T R U B _ S T R P N   :   L K K E A G M T S H D A V F K L R K I L G T K K I G H G G T L D P D V V G V L P I A V G K A T R   :   4 8
T R U B _ S T R P Y   :   L K K E A G M T S H D A V F K L R K L L Q E K K I G H G G T L D P D V V G V L P I A V G K A T R   :   4 8
T R U B _ S T R R 6   :   L K K E A G M T S H D A V F K L R K I L G T K K I G H G G T L D P D V V G V L P I A V G K A T R   :   4 8
T R U B _ S Y N E L   :   L N K P A G C T S H D C I N E L R R R L R L K R I G H G G T L D P M A T G V L P I A L G A A T R   :   4 8
T R U B _ S Y N P X   :   I D K P A G H T S H S C V S R L R R C Y G L K R V G H G G T L D P A V T G V L P I A L G P A T R   :   4 8
T R U B _ S Y N Y 3   :   L H K P L H L T S H D C V A K V R R L L R Q K R V G H G G T L D P L A E G V L P L A V G S A T R   :   4 8
T R U B _ T H E A C   :   L D K P Q G P T S H Q V D H W V R E I L G I E K V A H I G T L D P N V T G V L T M A I G K A V R   :   4 8
T R U B _ T H E M A   :   A Y K P K G P T S H D V V D E V R K K L K T R K V G H G G T L D P F A C G V L I I G V N Q G T R   :   4 8
T R U B _ T H E T 2   :   V D K P L H L T S H D V V E E A R R R L S T R R V G H T G T L D P L A T G L L L L V T N E S T K   :   4 8
T R U B _ T H E T N   :   V L K P P G M T S H D V V D F I R K I Y G I K K V G H T G T L D P D A A G V L P V C M G R A T K   :   4 8
T R U B _ T H E V O   :   I D K P Q G P T S H Q V D Y W V R Q I L G T E K V G H I G T L D P N V T G V L V M A I G K A V R   :   4 8
T R U B _ T R E D E   :   F A K Q A G L T S F A S M S A V K K A L S T K K V G H T G T L D L F A D G L L V L L T G Q L T R   :   4 8
T R U B _ T R E P A   :   F A K V S G L T S F A A L A Q V R R L L G V K K V G H T G T L D R F A D G L L L L L V G G F T K   :   4 8
T R U B _ T R O W 8   :   V D K I S G I T S H T A V A K I R H L T G V K K I G H C G T L D P A A C G L L I M G C G T A T R   :   4 8
T R U B _ T R O W T   :   V D K I S G I T S H T A V A K I R H L T G I K K I G H C G T L D P A A C G L L I M G C G T A T R   :   4 8
T R U B _ U R E P A   :   I N K P I K W T S N D V V Q K V K R V I G A K K V G H A G T L D P N A S G V L V L G I N E G T K   :   4 8
T R U B _ V I B C H   :   L D K P T G I S S N D A L Q K V K R L Y G A E K A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ V I B P A   :   L D K P T G I S S N D A L Q K V K R I Y F A E K A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ V I B V U   :   L D K P T G M S S N D A L Q K V K R L Y F A E K A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ V I B V Y   :   L D K P T G M S S N D A L Q K V K R L Y F A E K A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ W I G B R   :   L D K P I G L S S N L I L Q K I K K L F K A K K A G Y I G T L D P I A S G M L P I F F G D A T K   :   4 8
T R U B _ W O L S U   :   G Y K P M F M S S N H Y L Q R L K R R F G V K K A G Y S G T L D P F A K G V L V V A F G H Y T R   :   4 8
T R U B _ X A N A C   :   L D K P S G L S S N N A L Q A A R R L L R A E K G G H T G S L D P L A T G L L P L C F G E A T K   :   4 8
T R U B _ X A N C P   :   L D K P A G L S S N N A L Q A A R R L L R A E K G G H T G S L D P L A T G L L P L C F G E A T K   :   4 8
T R U B _ X Y L F A   :   L D K P A G I S S N S A L Q I A R R L L R A K K G G H T G S L D P L A T G L L P L C F G E A T K   :   4 8
T R U B _ X Y L F T   :   L D K P A G I S S N S A L Q V A R R L L R A K K G G H T G S L D P L A T G L L P L C F G E A T K   :   4 8
T R U B _ Y E R E N   :   L D K P L G L S S N D V L Q K V K R L F S A N R A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
T R U B _ Y E R P E   :   L D K P L G L S S N D V L Q K V K R L F S A N R A G H T G A L D P L A T G M L P I C L G E A T K   :   4 8
                          6   4 p   g   3 3       6       4             4   G H   G 3 L D P   a   G 6 6   6   6 g   a 3 4          


Степень консервативности колонок отображена цветом в соответствии с 4 уровнями консервативности. 
        В жёлтый цвет выкрашены колонки со степенью консервативности более 80% 
        B   зелёный  — более 60% 
        В   красный  — более 40% 
        B   белый    — ниже 40%.

Веса аминокислотных замен


Вычисление весов аминокислотных замен на основе множественного выравнивания блока TruB_N из базы данных BLOCKS
Пара аминокислот nαβ pαβ qα qβ sαβ
SER-SER 24143 0,02 0,051 0,051 6
SER-ALA 7390 0,006 0,051 0,08 -1
SER-ARG 4433 0,004 0,051 0,053 -1
Обозначения:
nαβ — количество пар аминокислот α и β, встречающихся в блоке.
pαβ — частота встречаемости пары аминокислот α и β.
qα — частота встречаемости аминокислоты α, то есть первой аминокислоты в паре.
qβ — частота встречаемости аминокислоты β, то есть второй аминокислоты в паре.
sαβ — вес аминокислотной замены для пары аминокислот α и β.

Вычисление весов аминокислотных замен на основе множественных выравниваний 200 блоков из базы данных BLOCKS

Обозначения:
nαβ — количество пар аминокислот α и β, встречающихся в блоке.
pαβ — частота встречаемости пары аминокислот α и β.
qα — частота встречаемости аминокислоты α, то есть первой аминокислоты в паре.
qβ — частота встречаемости аминокислоты β, то есть второй аминокислоты в паре.
sαβ — вес аминокислотной замены для пары аминокислот α и β.
Пара аминокислот nαβ pαβ qα qβ sαβ
SER-SER 2978161 0,013 0,069 0,069 3
SER-ALA 3560940 0,0155 0,069 0,085 1
SER-ARG 1699084 0,007 0,069 0,071 -1

Сравнение весов аминокислотных замен

Пара аминокислот Блок TruB_N 200 блоков BLOSUM62
SER-SER 6 3 4
SER-ALA -1 1 1
SER-ARG -1 -1 -2

Значения весов аминокислотных замен, вычисленные на основе множественного выравнивания 200 блоков из базы данных BLOCKS, и матрицы BLOSUM62 схожи.

Значения весов аминокислотных замен для пары аминокислот SER-ALA выше, чем для SER-ARG. Это обусловлено более схожим строением боковых групп серина и аланина, чем серина и аргинина.

Вес замены аминокислоты саму на себя имеет большее значение, чем значение веса аминокислотной замены для пары схожих аминокислот, подтверждением чему являются данные таблицы.

Различия весов аминокислотных замен, рассчитанных на основе блока TruB_N, относящегося к моему белку TRUB_ECOLI, с весами замен по данным матрицы BLOSUM62, связаны с количеством последовательностей, входящих в блок,а также со степенью родства белков, взятых из блока.

На главную страницу второго семестра.

© Армаш Татьяна,2005