Бутстреп-анализ выравнивания мутированных последовательностей, соответствующих листьям модельного дерева гена белка TRUB_ECOLI

Полученные консенсусные деревья

                       +------F
                +-91.0-|
         +-33.0-|      +------E
         |      |
  +------|      +-------------C
  |      |
  |      |             +------B
  |      +--------96.0-|
  |                    +------A
  |
  +---------------------------D

        +--------------------D
         |
  +------|             +------E
  |      |      +-82.0-|
  |      |      |      +------F
  |      +-31.0-|
  |             |      +------B
  |             +-86.0-|
  |                    +------A
  |
  +---------------------------C

ABCDEF	Модельное дерево	Bootstrap	Jackknife
**...	+	96,0	86,0
....**	+	91,0	82,0
..**..	+	33,0	31,0
..*.**	-	33,0	27,0

Косенсусное дерево, построенное с помощью метода Bootstrap, не совпадают с "истинным". В нем отсутствует ветвь, разделяющая листья на подмножества:CD и ABEF. По-видимому, это связанно с тем, что расстояние данной ветви маленькое (5).
Косенсусное дерево, построенное с помощью метода Jackknife, по топологии совпадает с модельным деревом гена белка TRUB_ECOLI.

На главную страницу третьего семестра

© Армаш Татьяна,2005