|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Белок CcaВ строке product для моего белка указано hypothetical protein - гипотетический белок. В качестве функции его дана tRNA nucleotidyltransferase, тРНК нуклеотидилтрансфераза. Вы можете ознакомиться с нуклеотидной и аминокислотной последовательностями этого белка. Информацию о длине аминокислотной и нуклеотидной последовательностей, длину белка и длину кодирующего его гена, локус гена, тип цепи см. в таблице 1.
Информация в различных базах данных
Сравнение первой и последней версий записи в Uniprot Первая версия была создана 05.02.2008, последняя (51) была создана 04.02.2015. Были добавлены 2 комментария про каталитическую активность и сходство с другимим белками: Также было добавлено 24 ссылки на другие базы данных, такие как RefSeq, Pfam и т.д. Для возможности поиска этого белка по функции и другим категориям были добавлены 10 строк с ключевыми словами: Статус белка был переведен из "Predicted" в "Inferred from homology", т.е. появилась информация об ортологах у близкородственных видов, хотя данных об экспресии этого гена и тем более экспериментальных доказательствах его существования нет: Во многих строках были добавлены ссылки на достоверность источника информации в {}, например: Сравнение записи Uniprot моего белка с записями гомологов Таблица с записями Сравниваются 4 белка: Cca protein - "мой" белок; CCA-adding enzyme - белок гомолог, для которого был указан PDB-код; тРНК нуклеотидилтрансфераза и некий неопределенный белок, принадлежащие к кластеру Cca protein. Самые заметные отличия носит запись о Cca-adding enzyme, его существование было подтверждено экспериментально (колнка Protein existence), были изучены его особенности (колнка Features), точно известна его функция и даже есть 3D модели его структуры. Существование трех других белков предполагается из гомологии, соответственно про их функцию и особенности нет подтвержденной информации. Отражение особенностей белка в записи Uniprot В записях uniprot отражаются интересные и редкие особенности белков. Например наличие селеноцистеина, образующего ковалентные связи между белками или частями белка (пример взят из запсиси по белку Thioredoxin reductase 1, АС - Q9MYY8). |