Занятие 2. Реконструкция филогении.
Таксономия выбранных бактерий:
Название |
Систематика |
Rhizobium etli |
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Rhizobium/Agrobacterium group; Rhizobium |
Rhodobacter sphaeroides |
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter |
Escherichia coli |
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia |
Salmonella typhimurium |
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Salmonella; Salmonella enterica; Salmonella enterica subsp. enterica |
Yersinia pseudotuberculosis |
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Yersinia; Yersinia pseudotuberculosis complex |
Vibrio cholerae |
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Vibrionales; Vibrionaceae; Vibrio |
Pasteurella multocida |
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pasteurellales; Pasteurellaceae; Pasteurella |
Proteus mirabilis |
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Proteus |
Изображение дерева
Соответствие нетривиальных ветвей дерева таксонам:
(RHIEC, RHOS4) против (VIBCH, PASMU, PROMH, YERPS, ECOLI, SALTY) выделяет классы Alphaproteobacteria и Gammaproteobacteria
(RHIEC, RHOS4, VIBCH) против (PASMU, PROMH, YERPS, ECOLI, SALTY)
(RHIEC, RHOS4, VIBCH, PASMU) против (PROMH, YERPS, ECOLI, SALTY) отделяет семейство Enterobacteriaceae от других групп
(RHIEC, RHOS4, VIBCH, PASMU, PROMH) против (YERPS, ECOLI, SALTY)
(RHIEC, RHOS4, VIBCH, PASMU, PROMH, YERPS) против (ECOLI, SALTY)
|