Филогенетическое дерево

Из предложенного списка бактерий были выбраны следующие:

Скобочная формула

((((STRP1, LACLM), LACAC), (STAAR, (GEOKA, BACAN))), (MOOTA, CLOTE));

Получившееся дерево

Нетривиальные ветви дерева

Дерево содержит пять нетривиальных ветвей:

1) {STRP1, LACLM} против {LACAC, STAAR, GEOKA, BACAN, MOOTA, CLOTE}

2) {STRP1, LACLM, LACAC} против {STAAR, GEOKA, BACAN, MOOTA, CLOTE}

3) {STRP1, LACLM, LACAC, MOOTA, CLOTE} против {STAAR, GEOKA, BACAN}

4) {STRP1, LACLM, LACAC, MOOTA, CLOTE, STAAR} против {GEOKA, BACAN}

5) {STRP1, LACLM, LACAC, STAAR, GEOKA, BACAN} против {MOOTA, CLOTE}

Таксономия

С помощью сайта NCBI была найдена таксономия каждого организма. Все данные приведены в таблице. На рисунке показано, какие нетривиальные ветви на дереве выделяют какой-либо таксон. По нему видно, что построенное дерево хорошо соотносится с таксономическими отношениями между данными видами.