KEGG

1) Номер метаболичесого пути: 00770. На рисунке 1 можно увидеть его изображение.

Метаболический путь
Рисунок 1. Метаболический путь 00770

2) Далее цветом подсвечивалась реакция R01226, которую катализирует фермент 2.1.2.11 (рисунок 2).

Метаболический путь
Рисунок 2. Метаболический путь 00770 с выделенной реакцией R01226

3) Реакция превращения 3-Methyl-2-oxobutanoic acid (C00141) в 2-Dehydropantoate (C00966) (рисунок 3) является многоступенчатой. По сути это реакция переноса группы -CH2OH от 5,10-Methylenetetrahydrofolate (C00143) к третьему углероду в главной цепи 3-Methyl-2-oxobutanoic acid в присутствии воды.

Реакция
Рисунок 3. Реакция

4) Фермент, катализирующий реакцию, - транфераза 3-метил-2-оксобутановой кислоты.

5) Его код - 2.1.2.11. Он относится к трансферазам, поэтому класс 2. Подкласс 1, так как она переносит одноуглеродную группы (сюда включается и гидроксиметил). Под-подкласс 2 включает именно гидроксиметил и формил трансферазы и это одиннадцатый фермент в данной группе.

6) Также на рисунке 4 можно увидеть данный метаболический путь у человека и дрожжей (Saccharomyces cerevisiae). В основном у этих двух организмов окрашены разные ферменты.

МП МП
Рисунок 4. Метаболический путь человека (верхнее изображение) и дрожжей (нижнее).

7) У Saccharomyces cerevisiae 115 метаболических путей и 6417 генов (KEGG genes).