therandomnesskingdom: pr6

Описание метилтрансферазы Е РНК большой рибосомальной субчастицы из генома археи Thermoplasma volcanium GSS1.

1. Основная информация о белке

Получив идентификатор белка, зашли на сайт NCBI и нашли свой белок, затем перешли на страницу нуклеотидной записи, из которой получен белок и скачали файл с нуклеотидной записью.

Таблица 1. Описание метилтрансферазы Е РНК большой рибосомальной субчастицы из генома археи *Thermoplasma volcanium* GSS1.
Идентификатор белка	BAB59434.1
Идентификатор генома	BA000011.4
Название белка	Метилтрансфераза Е РНК большой рибосомальной субчастицы
Координаты гена в геноме	303361..303954
Длина гена (п.н.)	594
Цепь	Прямая
Длина белка (а.о.)	197

Скачать последовательность белка можно здесь. Скачать

Рибосомальная РНК большой субъединицы метилтрансферазы Е метилирует 23S рРНК. Она направленно метилирует уридин в положении 2552 23S рРНК в частице 50S, используя S-аденозил-L-метионин в качестве субстрата . Ранее этот фермент был известнен как белок клеточного деления FtsJ. Белок сам по себе достаточно мал, что характерно для белков бактерий

2. Геномное окружение гена белка

Для того, чтобы получить изображение геномного окружения для своего белка, проделали следующие действия. Сначала открыли геномный браузер для своего генома (на сайте NCBI). Затем нашли свой белок по его координатам, включили режим просмотра рамок считывания и сохранили изображение.

genome image — Рисунок 1. Геномное окружение гена белка метилтрансферазы Е РНК большой рибосомальной субчастицы (идентификатор белка BAB59434.1). Изображение получено с помощью геномного браузера NCBI. Вверху изображены рамки считывания +1, +2, +3, -1, -2, -3. Гены предсавлены ниже красными полосами. Направление считывания отображено стрелками внутри полос. Старт-кодоны - зелёные метки, а стоп-кодоны - красные.

Выполнение данного практикума очень впечатлило меня. Я открыла для себя столько новых способностей в мире бионформатики!

Все клубнично-отлично.