name	AC	ID	full	seed	Domain architectures
NADH-quinone oxidoreductase cyanobacterial subunit N	PF11909	NdhN	345	41	4

Функция домена

Домен целиком представляет собой субъединицу НАДН-хинон оксидоредуктазы - фермента который катализирует перенос электронов с НАД(Ф)Н на хинон с сопутствующей перекачкой протонов через мембрану, является первым комплексом электрон-транспортной цепи дыхания, а также принимает участие в циклическом фотосинтезе. Субъединица N встречается в НАДН-хинон оксидоредуктазе, расположенной в тилакоидах фотосинтезирующих организмов. Функция конкретно N-субъединицы неизвестна.

Структура домена

Домен состоит главным образом из неупорядоченных структур, однако также в нём есть 3 α-спирали и один β-лист.

Распространенность домена

Домен встречается у цианобактерий, зелёных водорослей, которые получили хлоропласты в результате эндосимбиоза с цианобактерией, высших растений, и у паулинелл, которые получили свой хлоропласт в результате эндосимбиоза с зелёной водорослью.

Выравнивание seed

В выравнивании есть абсолютно консервативные позиции: EGG 28-30, E 31, GY 43-44, GD 55-56, H 65, 73 G, 110 W, 121 E, 140 E. Помимо них в выравнивании есть максимальные достоверные блоки: у всех последовательностей 11-73 и 107-152 позиции выравнивания. У последовательностей 1-24 есть обширный достоверный блок с 1 по 89 позицию. На 17-18 позициях, на N-конце выравнивания (151-152 позиции) находятся участки, в которых нельзя выделить подблоки. Из всех этих данных можно сделать заключение о том, что в подавляющей части выравнивание вероятнее всего отражает ход эволюции, за исключением некоторых позиций(тех, которые входят в области где нельзя выделить подблоки).