Выбор белка

В качестве белка для практикума я выбрал тРНК диметилаллилтрансферазу(ID:MIAA_ACIF5, AC:B5EJE8), найденную мной по запросу (taxonomy_id:920) AND (reviewed:true) AND (protein_name:trna) среди других 37 результатов. Этот белок приглянулся мне своей интересной функцией - посттранскрипционной модификацией тРНК, наличием с довольно-таки большой уверенностью предсказанной структуры и относительно хорошей оценкой аннотации(3/5, тогда как у половины других белков 2/5). Фермент - лигаза, которая присоединяет диметилаллильную группу диметилаллилпирофосфата к аденозиновому остатку на 37 позиции тРНК по N⁶ с высвобождением пирофосфата.

Расширенный поиск в Uniprot

• По запросу (taxonomy_id:920) AND (protein_name:tRNA dimethylallyltransferase) я нашёл 3 записи о белках имеющих такое же название у данного организма.
• По запросу (protein_name:"tRNA dimethylallyltransferase") NOT (cc_scl_term:SL-0086) AND (cc_scl_term:*) я нашёл 13 результатов - записей о белках с таким же названием, которые располагаются где-либо помимо цитозоля, при чём во всех случаях это белки из грибов подцарства Dikarya, у которых они располагаются в ядре.
• Также, введя (protein_name:"tRNA dimethylallyltransferase") NOT (cc_scl_term:SL-0191) AND (cc_scl_term:*) AND (taxonomy_id:451864), я обнаружил, что ни у кого из подцарства Dikarya не найдено белков тРНК диметилаллилтрансфераз, которые бы локализовались не в ядре.
• Поиск (cc_function:"tRNA processing") AND (taxonomy_id:451864) NOT (cc_scl_term:SL-0173) выдал 2 белка, которые участвуют в процессинге тРНК у Dikarya, при чем оказалось что оба из них находятся в ядре.

Полученные в результате поиска данные могут значить что присоединение диметилаллильного остатка к тРНК у высших грибов происходит раньше чем у остальных организмов - ещё в ядре.