В данном примере видим водородные связи в составе остова белка, беспечивающие структуру альфа-пирали
Остатки цистеина в составе белка находятся друг от друга на расстоянии, большем, чем длина ковалентной связи
Между остатками фенилаланина, вероятно есть Т-стекинговое взаимодействие - их ароматические кольца располагаются взаимоперпендикулярно на допустимом для такой связи расстоянии.