Практикум 1. Филогенетические деревья

Задание 1

Отобранные бактерии
  1. Streptococcus pyogenes serotype M1 - STRP1
  2. Streptococcus pneumoniae serotype 4 - STRPN
  3. Lactococcus lactis subsp. cremoris - LACLM
  4. Lactobacillus acidophilus - LACAC
  5. Enterococcus faecalis - ENTFA
  6. Listeria monocytogenes serovar 1/2a - LISMO
  7. Bacillus subtilis - BACSU
Скобочная формула
(((((STRP1,STRPN),LACLM),LACAC),ENTFA),(LISMO,BACSU))
Изображение
Phyl_tree
Рисунок 1. Филогенетическое дерево.
Нетривиальные ветви и таксоны
  1. {STRP1,STRPN} против {LACLM,LACAC,ENTFA,LISMO,BACSU}; соотвествует таксону Streptococcus
  2. {STRP1,STRPN,LACLM} против {LACAC,ENTFA,LISMO,BACSU}; соотвествует таксону Streptococcaceae
  3. {STRP1,STRPN,LACLM,LACAC} против {ENTFA,LISMO,BACSU};
  4. {STRP1,STRPN,LACLM,LACAC,ENTFA} против {LISMO,BACSU}; соовествует таксону Lactobacillales
Таксоны бактерий
  1. Streptococcus pyogenes serotype M1 - cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Streptococcaceae; Streptococcus; Streptococcus pyogenes
  2. Streptococcus pneumoniae serotype 4 - cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Streptococcaceae; Streptococcus; Streptococcus pneumoniae
  3. Lactococcus lactis subsp. cremoris - cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Streptococcaceae; Lactococcus; Lactococcus lactis
  4. Lactobacillus acidophilus - cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus
  5. Enterococcus faecalis - cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Enterococcaceae; Enterococcus
  6. Listeria monocytogenes serovar 1/2a - cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Listeriaceae; Listeria; Listeria monocytogenes
  7. Bacillus subtilis - cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus; Bacillus subtilis group