Контакты
Работа с программой Rasmol
Thiodigalactoside ( тиодигалактозид )
Молекулярная формула:C12H22O10S1
 |
 |
Исследованы контакты между атомами лигандов и атомами наиболее близко расположенных к ним аминокислотных остатков белка. При помощи программы Rasmol были выявлены следующие взаимодействия:
| Цепь белка |
1-ый контакти- рующий остаток |
2-ый контактирующий остаток (лиганд) |
Контактирую- щие атомы |
Расстояние в ангстремах |
Тип связи |
| А | ARG144A.NH2 | TDG500.O3 | NH2-O3 | 3,09 | Водородная |
| А | LYS358A.NZ | TDG500.O4' | NZ-O4' | 3,17 | Водородная |
| А | LYS358A.NZ | TDG500.O3' | NZ-O3' | 2,89 | Водородная |
| А | MET23A.SD | TDG500.O6 | SD-O6 | 4,08 | Гидрофобная |
| А | MET23A.CE | TDG500.O4 | CE-O4 | 2,99 | Электростатическая |
| В | LYS358B.NZ | TDG1500.O3' | NZ-O3' | 2,82 | Водородная |
| В | LYS358B.NZ | TDG1500.O4' | NZ-O4' | 3,24 | Водородная |
| В | ARG144B.NH2 | TDG1500.O3 | NH2-O3 | 3,23 | Водородная |
| В | GLU269B.OE1 | TDG1500.O3 | OE1-O3 | 3,34 | Гидрофобная |
| В | GLU269B.OE2 | TDG1500.O3 | OE2-O3 | 3,89 | Гидрофобная |
| В | VAL326B.CG1 | TDG1500.O2 | CG1-O2 | 3,82 | Гидрофобная |
| В | MET23B.CE | TDG1500.O4 | CE-O4 | 3,19 | Гидрофобная |
