Фрагмент вторичной структуры

Работа с программой Rasmol

Исследовался фрагмент вторичной структуры с 20 по 34 аминокислотный остаток цепи А. Была отмечена закономерность в образовании водородных связей между атомами:

LEU34A.N PHE30A.O
TRP33A.N PHE29A.O
ILE32A.N PRO28A.O
PHE30A.N TYR26A.O
PHE29A.N ALA25A.O
PHE27A.N MET23A.O
TYR26A.N ILE22A.O
ALA25A.N PHE21A.O
GLY24A.N PHE20A.O

Паттерн образования водородных связей: i => i+4
При выделении Сb-атомов в программе Rasmol видно их расположение по спирали относительно оси симметрии структуры.

Назад