Доменная структура белка LacY_ECOLI

База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью профиля-НММ.

Согласно базе данных PFAM в белке LacY_ECOLI существует 1 домен.
Изображение доменной структуры LacY_ECOLI:

Описание домена:

краткое название: LacY_symp

расположение в последовательности:с 1 по 413 аминокислотный остаток

идентификатор записи в PFAM: PF01306

краткое описание свойств домена:

контролирует перенос различных сахаров внутрь с сопровождающимся симпортом ионов водорода.
Вообще, в бактериях существует набор семейств транспортных белков, включая симпортеров и антипортеров.
Например, белки семейства LacY у Escherichia coli и Klebsiella pneumonia играют роль протон/-галактоза симпортеров, которые, как и большинство сахарных транспортеров, являются интегральными белками мембраны с 12 предсказанными трансмембранными областями. Также похожими на LacY являются семейства рафинозных пермеаз (rafB) и сахарозных пермеаз (cscB) из E. coli.

На pdb структуре 1pv7 в программе Rasmol розовым были отмечены все аминокислотные остатки, входящие в домен LacY_symp, голубым – те, которые не вошли в изучаемый домен.