Прежде всего

script_v2.spt — скрипт из прошлой работы, дополненный еще одной схемой (угол φ в проекции из второго упражнения).
map.ods — карты Рамачандрана (при экспорте в xls одна из диаграмм почему-то теряет третий слой, поэтому ods)

Упражнение первое

Десятый остаток моего белка — серин. Составим для него таблицу торсионных углов. Для этого нам потребуется также отобразить предыдущий и следующий остатки. Здесь:

1. GLY9:A.C — карбонильный углерод девятого (предыдущего) остатка цепи А
2. SER10:A.N — азот аминогруппы десятого (текущего) остатка
3. SER10:A.CA — альфа-углерод десятого остатка
4. SER10:A.C — карбонильный углерод десятого остатка
5. ASN11:A.N — азот аминогруппы одиннадцатого (следующего) остатка
6. ASN11:A.CA — альфа-углерод одиннадцатого остатка

Измеренные торсионные углы для десятого остатка таковы:

Угол	Атомы	Связь	Угол в градусах
φ	1—4	N10—Cα10	−81.34
ψ	2—5	Cα10—C''10	−17.74
ω	3—6	C''10—N11	+179.88

Упражнение второе

Эта схема иллюстрирует угол φ в проекции:

Упражнение третье

Команда save rpp обладает очень забавным выводом, который живо напомнил мне какой-то старый фильм про ученых, где было много матричных принтеров, из которых все время вылазили ленты распечаток. Поэтому лучше все-таки табличный процессор. Не Excel, конечно, а LibreOffice Calc.

Карта для всех, пролинов и глицинов

Карта для всех, α-спиралей и бета-листов