# | Имена атомов | Длина связи | Угол N-O-C (°) |
Альфа-спирали | |||
1 | [HIS]160:A.N #6891-[GLN]158:A.O #6876 | 3.46 | 84.1 |
6 | [LEU]37:B.O #8128-[ILE]41:B.N #8156 | 2.92 | 113.7 |
Бета-тяжи | |||
2 | [ASN]120:F.N #3106-[ALA]116:F.O #3076 | 3.37 | 93.9 |
3 | [GLU]36:B.N #8116-[ALA]33:B.O #8094 | 2.94 | 116.5 |
4 | [SER]19:B.O #7985-[GLY]23:B.N #8018 | 3.28 | 137.1 |
5 | [HIS]247:B.O #9831-[VAL]251:B.N #9862 | 2.9 | 147.2 |
6 | [LYS]14:F.N #2259-[GLY]10:F.O #2233 | 2.96 | 126.2 |
Типичные значения длины водородной связи-около 3 ангстрем. Среднее значение 3.12, дисперсия 0.05835,
среднеквадратическое отклонение 0.24155, среднее линейное отклонение 0.21551.
Угол N-O-C принимает значения в среднем около 120°. Среднее значение угла равно 116.97°. Дисперсия равна 504.64, среднеквадратическое отклонение 22.464, среднее линейное отклонение 17.037.
Также можно заметить, что в бета-тяже намного больше водородных связей, чем в альфа-спирали.
Можно сделать вывод, что длина водородной связи более стабильная величина, чем угол N-O-C. Это можно объяснить тем, что энергия
водороной связи регулируется законом Кулона: частичными зарядами образующих связь атомов в первой степени и квадратом расстояния
между ними. Так как энергия водородной связи чаще всего варьируется не более чем в 2 раза(3-7 ккал/моль), то расстояние
изменяется не более чем в 1.4 раза. Зависимость длины водородной связи от стерического фактора намного меньше,
чем зависимость угла N-O-C поэтому длина водородной связи варьирует меньше. Так как энергия водородной связи меньше, чем энергия
ковалентной связи(около 100 ккал/моль) в 15-30 раз, то длина связи больше в 4-6 раз:
длина водородной связи 3.12 ангстрем, ковалентной около 0.6 ангстрем. Угол N-O-C чаще всего больше 100° так как возникает
отталкивание между областями повышенной электронной плотности на ковалентных связях O-C и N-H.