Отчет по практикуму 2. Задание 3. Создание изображение белка в комплексе с ДНК.
На этой странице выложен отчет по заданию 3 практикума 2.
1.
Скрипт Scr1 для задания 3b
Скрипт Scr2 для задания 3c
Скрипт DNASCR для задания 4a
Скрипт Donors для задания 4b
На картинке изображена молекула ДНК, к которой присоединены несколько цепочек белка. Белок может взаимодействовать с ДНК за счет ионных связей.
При этом могут формироваться ДНК-белковые комплексы, которые могут участвовать в транскрипции в составе рибосом.
4.
a)
Белок взаимодействует в основном с сахарофосфатным остовом ДНК. В месте ДНК-белкового контакта двойная спираль ДНК расплетена,
а одна из цепей ДНК разорвана, вторая на участке, на котором взаимодействует с белком целиком погружена в белок.
Результаты получены путем окрашивания белка в Jmol черным цветом, сахарофосфатного остова зеленым, азотистых оснований желтым,
и изучения его взаимодействия с ДНК. Увидеть визуализацию можно с помощью скрипта DNASCR.
b)На картинке показаны доноры(обозначены синим) и акцепторы(обозначены красным).