Практикум 4. Биологическая единица..
На этой странице выложен отчет по практикуму 4. Биологическая единица.
1. Ассиметрическая единица меньше биологической единицы.
Ассиметрическая единица - минимальная часть структуры, из которой можно восстановить кристалл, используя трансляционную и нетриансляционную симметрию.
Биологическая единица - это минимальная биологически значимая с точки зрения функциональности часть кристалла.
Чтобы привести пример,был использован advanced search с параметрами Number of chains (Assymetric Unit) - 1 и
Number of chains (Biological Assembly) - от 2 до 4. Была выбрана структура с идентификатором
6L6AВ.
Рис. 1. Биологическая единица, которая представляет собой гомодимер.
Рис. 2. Ассиметрическая единица, представляющая собой мономер.
2. Ассиметрическая единица больше биологической единицы.
Чтобы привести пример,был использован advanced search с параметрами Number of chains (Assymetric Unit) - от 2 до 4 и
Number of chains (Biological Assembly) - 1. Была выбрана структура с идентификатором 6JYJ. В статье
описана структура этого белка. Ассиметрическая единица - тример.
Рис. 3. Биологическая единица.
Рис. 4. Ассиметрическая единица.
Ссылки:
[1] Hodge T. & Cope M.J.T.V. 2000. A myosin family tree. Journal of Cell Science 113:3353-3354.
[2] Briggs G.S., Smits W.K., Soultanas P. (2012). Chromosomal Replication Initiation Machinery of Low-G+C-Content Firmicutes. J Bacteriol. 194, 5162-70.
[3] Semova, I., Carten, J.D., Stombaugh, J., Mackey, L.C., Knight, R., Farber, S.A., and Rawls, J.F. (2012). Microbiota Regulate Intestinal Absorption and Metabolism of Fatty Acids in the Zebrafish. Cell Host Microbe 12, 277-288.
[4] Backhed, F., Ding, H., Wang, T., Hooper, L.V., Koh, G.Y., Nagy, A., Semenkovich, C.F., and Gordon, J.I. (2004). The gut microbiota as an environmental factor that regulates fat storage. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101, 15718–15723.