Для построения филогенетического дерева были выбранны следующие бактерии:
Бактерия | Мнемоника | Таксономия |
Rubrobacter xylanophilus | RUBXD | Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Rubrobacteria; Rubrobacterales; Rubrobacteraceae; Rubrobacter |
Leifsonia xyli | LEIXX | Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Micrococcales; Microbacteriaceae; Leifsonia |
Thermobifida fusca | THEFY | Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Streptosporangiales; Nocardiopsaceae; Thermobifida |
Streptomyces avermitilis | STRAW | Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Kitasatosporales; Streptomycetaceae; Streptomyces |
Corynebacterium efficiens | COREF | Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Corynebacteriaceae; Corynebacterium |
Mycobacterium leprae | MYCLE | Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium |
Rhodococcus jostii | RHOJR | Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Nocardiaceae; Rhodococcus |
((((STRAW, THEFY), LEIXX), ((MYCLE, RHOJR), COREF)), RUBXD);
На основании выбранных бактерий и составленой скобочной формулы было построенно филогенетическое дерево. Для построения использовался онлайн-сервис (iTOL).
Рис.1.Филогенетическое дерево для выбранных организмов
Полученное дерево содержит 4 нетривиальные ветви:
1) {MYCLE, RHOJR} против {RUBXD, COREF, LEIXX, RHIME, THEFY, STRAW}
2) {MYCLE, RHOJR, COREF} против {RUBXD, LEIXX, RHIME, THEFY, STRAW} - ветвь отражает порядок Mycobacteriales.
3) {THEFY, STRAW} против {RUBXD, COREF, LEIXX, RHIME, MYCLE, RHOJR}
4) {THEFY, STRAW, LEIXX} против {RUBXD, COREF, RHIME, MYCLE, RHOJR} - самый "низкий" общий таксон, отражающий единство организмов этой ветви - класс Actinomycetes.