Филогенетическое дерево.

Отобраные бактерии

Для построения филогенетического дерева были выбранны следующие бактерии:

Таб.1.Список выбранных видов бактерий

Бактерия Мнемоника Таксономия
Rubrobacter xylanophilus RUBXD Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Rubrobacteria; Rubrobacterales; Rubrobacteraceae; Rubrobacter
Leifsonia xyli LEIXX Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Micrococcales; Microbacteriaceae; Leifsonia
Thermobifida fusca THEFY Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Streptosporangiales; Nocardiopsaceae; Thermobifida
Streptomyces avermitilis STRAW Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Kitasatosporales; Streptomycetaceae; Streptomyces
Corynebacterium efficiens COREF Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Corynebacteriaceae; Corynebacterium
Mycobacterium leprae MYCLE Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium
Rhodococcus jostii RHOJR Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Nocardiaceae; Rhodococcus

Скобочная формула дерева

((((STRAW, THEFY), LEIXX), ((MYCLE, RHOJR), COREF)), RUBXD);

Филогенетические деревья

На основании выбранных бактерий и составленой скобочной формулы было построенно филогенетическое дерево. Для построения использовался онлайн-сервис (iTOL).

tree

Рис.1.Филогенетическое дерево для выбранных организмов

Ветви дерева

Полученное дерево содержит 4 нетривиальные ветви:

1) {MYCLE, RHOJR} против {RUBXD, COREF, LEIXX, RHIME, THEFY, STRAW}

2) {MYCLE, RHOJR, COREF} против {RUBXD, LEIXX, RHIME, THEFY, STRAW} - ветвь отражает порядок Mycobacteriales.

3) {THEFY, STRAW} против {RUBXD, COREF, LEIXX, RHIME, MYCLE, RHOJR}

4) {THEFY, STRAW, LEIXX} против {RUBXD, COREF, RHIME, MYCLE, RHOJR} - самый "низкий" общий таксон, отражающий единство организмов этой ветви - класс Actinomycetes.

© Тумбинский Роман, ФББ МГУ, 2022