Дерево гомологов CLPX_ECOLI

Гомологи белка CLPX были найдены с помощью standalone blastp. Поиск проводился по протеомам бактерий, представленных в Таблице 1. Дерево, изображенное на Рисунке 1, было реконструировано в программе MEGA методом UPGMA.

Neisseria meningitidis NEIMA
Thiobacillus denitrificans THIDA
Polynucleobacter asymbioticus POLAQ
Roseobacter denitrificans ROSDO
Paracoccus denitrificans PARDP
Bartonella henselae BARHE
Rhizobium meliloti RHIME

Таблица 1. Названия и мнемоники бактерий, по протеомам которых проводился поиск гомологов белка CLPX.

Рисунок 1. Дерево гомологов CLPX. Цветными блоками ограничены группы ортологов. Оранжевые точки в узлах дерева указывают на произошедшие дупликации, серые - на разделение путей эволюции белков путем видообразования. Примеры пар паралогов: CLPX BARHE - HSLU BARHE, CLPX ROSDO - RUVB ROSDO, HSLU PARDP - A1ZV8 PARDP.