Дерево гомологов CLPX_ECOLI
Neisseria meningitidis | NEIMA |
Thiobacillus denitrificans | THIDA |
Polynucleobacter asymbioticus | POLAQ |
Roseobacter denitrificans | ROSDO |
Paracoccus denitrificans | PARDP |
Bartonella henselae | BARHE |
Rhizobium meliloti | RHIME |
Таблица 1. Названия и мнемоники бактерий, по протеомам которых проводился поиск гомологов белка CLPX.
Рисунок 1. Дерево гомологов CLPX. Цветными блоками ограничены группы ортологов. Оранжевые точки в узлах дерева указывают на произошедшие дупликации, серые - на разделение путей эволюции белков путем видообразования. Примеры пар паралогов: CLPX BARHE - HSLU BARHE, CLPX ROSDO - RUVB ROSDO, HSLU PARDP - A1ZV8 PARDP.
Гомологи белка CLPX были найдены с помощью standalone blastp. Поиск проводился по протеомам бактерий, представленных в Таблице 1. Дерево, изображенное на Рисунке 1, было реконструировано в программе MEGA методом UPGMA.