| Метод | Описание (pdb) | График энергий | Гистограмма длин связей C-C |
| Берендсена | be Молекула быстро вращается вокруг связи C-C и поворачивается вдоль оси связи. |
|
|
| Velocity rescale | vr Молекула, постепенно ускоряясь, вращается вокруг середины связи С-С. |
|
|
| Нуза-Хувера | nh Молекула вращается вокруг своей оси, длина связи С-С не меняется. |
|
|
| Андерсена | an Молекула практически не движется - отсутствуют вращение и поворот, слегка меняется длина С-С связи |
|
|
| Стохастической молдинамики | sd Хаотичное движение во всех направлениях |
|
|