Обратно на главную
Вернуться назад к проектам.

E.coli:MALATE DEHYDROGENASE(малат-дегидрогиназа).

1)Список идентификаторов белка и гена.

- Краткое название гена:  r153c
- Полное название организма:    Escherichia coli, K-12
- Идентификатор записи банка SwissProt:     MDH_ECOLI
- AC последовательности:  P61889
- PDB-код пространственной структуры белка:  1IB6

2)Последовательность в формате FASTA.

>MDH_ECOLI thr operon leader peptide                                
MRVLKFGGTSVANAERFLRVADILESNARQGQVATVLSAPAKITNHLVAMIEKTISGQD
ALPNISDAERIFAELLTGLAAAQPGFPLAQLKTFVDQEFAQIKHVLHGISLLGQCPDSI
NAALICRGEKMSIAIMAGVLEARGHNVTVIDPVEKLLAVGHYLESTVDIAESTRRIAAS
RIPADHMVLMAGFTAGNEKGELVVLGRNGSDYSAAVLAACLRADCCEIWTDVDGVYTCD
PRQVPDARLLKSMSYQEAMELSYFGAKVLHPRTITPIAQFQIPCLIKNTGNPQAPGTLI
GASRDEDELPVKGISNLNNMAMFSVSGPGMKGMVGMAARVFAAMSRARISVVLITQSSS
EYSISFCVPQSDCVRAERAMQEEFYLELKEGLLEPLAVTERLAIISVVGDGMRTLRGIS
AKFFAALARANINIVAIAQGSSERSISVVVNNDDATTGVRVTHQMLFNTDQVIEVFVIG
VGGVGGALLEQLKRQQSWLKNKHIDLRVCGVANSKALLTNVHGLNLENWQEELAQAKEP
FNLGRLIRLVKEYHLLNPVIVDCTSSQAVADQYADFLREGFHVVTPNKKANTSSMDYYH
QLRYAAEKSRRKFLYDTNVGAGLPVIENLQNLLNAGDELMKFSGILSGSLSYIFGKLDE
GMSFSEATTLAREMGYTEPDPRDDLSGMDVARKLLILARETGRELELADIEIEPVLPAE
FNAEGDVAAFMANLSQLDDLFAARVAKARDEGKVLRYVGNIDEDGFTVCRVKIAEVDGN
DPLFKVKNGENALAFYSHYYQPLPLVLRGYGAGNDVTAAGVFADLLRTLSWKLGV

3)Общий вид пространственной структуры.

Иллюстрация белка

Рис.№1.Общий вид пространственной структуры.
Альфа спирали показаны в ленточной модели, раскраска по цепям.
Бета структуры представлены в ленточной модели(выделены красным цветом)
Лиганды(NAD) представлены в шарнирной модели, раскраска по атомам.
Все остальные компаненты в проволочной модели с каскраской по цепям.

Больше о данном белке вы можете узнать здесь: PDBSum или в полной версии моего отчета


Обратно на главную
Вернуться назад к проектам.

© Turgenev