Работа с системой PubMed. 17.02.2007


Задание №1.
Найдите ссылки на статьи, в которых упоминается полное название Вашего белка. Приведите в протоколе это название и количество найденных статей.
Первоначальный запрос:
"aminodeoxychorismate synthase, subunit I"(Было взято в кавычки).
Ответ системы: статей с точной цитатой не найдено.
Второй запрос: "aminodeoxychorismate synthase"(Было взято в кавычки, хотя на поиск не влияет, без кавычек найдено то же самое). Найдено 22 статьи.
Задание №2.
Сохраните результаты поиска в виде текста в файл query1.txt
Результаты поиска
Задание №3.
Из списка найденных статей выберите одну. Сохраните её аннотацию ("Abstract") в текстовом формате в файл abstract.txt.
Найдите ссылки на все публикации последнего автора этой статьи за последние 3 года. В протоколе укажите число статей;
результаты поиска сохраните в виде текста в файл "query2.txt"
 Выбрана статья:
Dixon S, Ziebart KT, He Z, Jeddeloh M, Yoo CL, Wang X, Lehman A, Lam KS, Toney MD, Kurth MJ. «Aminodeoxychorismate synthase inhibitors from one-bead one-compound combinatorial libraries: "staged" inhibitor design». J Med Chem. 2006 Dec 14;49(25):7413-26. PMID: 17149871 [PubMed - in process]
Аннотация
Поиск статей Kurth MJ за последние три года:
Kurth MJ[author] AND "2004/02/17 12.02"[PDAT] : "2007/02/17 12.02"[PDAT]
Результаты поиска
Задание №4.
Найдите ссылки на статьи об опоясывающем лишае (shingles). Отобразите результат поиска в виде последовательных аннотаций (abstracts).
Сохраните первую страницу результатов в файл query3.txt.
Отметьте в протоколе, как PubMed распознает "разговорное" название "shingles"?
Первая страница аннотаций по статьям по опоясывающему лишаю
Pubmed трактует "разговорное" «shingles» как "herpes zoster".
Полная трактовка:
("herpes zoster"[TIAB] NOT Medline[SB]) OR "herpes zoster"[MeSH Terms] OR shingles[Text Word].

Дополнительные задания.
№1. Найдите ссылки на публикации о кровотечении из носа (nosebleed) при гипертонии (hypertension).
Как PubMed распознал термин "nosebleed"? Отобразите все полученные ссылки на одной странице и сохраните в файл
query_add1.txt .
Запрос: nosebleed AND hypertension. Найдено 125 статей.
Запрос «Nosebleed» распознается как ("epistaxis"[TIAB] NOT Medline[SB]) OR "epistaxis"[MeSH Terms] OR nosebleed[Text Word], т.е. «Nosebleed» = "epistaxis".

№2. Найдите ссылки на публикации о генетически модифицированной еде (genetically modified food). Отобразите результаты поиска в виде списка аннотаций и сохраните в файл query_add2.txt

№3. 3. Найдите информацию о болях зуба мудрости. Используя опцию Details, узнайте как распознается термин
(не забудьте упомянуть в отчёте сам термин по-английски!) и приведите определение этого термина согласно MeSH.
Зуб мудрости – wisdom tooth.
Запрос –« wisdom tooth ache ».
Термин «wisdom tooth» распознается как ("third molar"[Text Word] OR "molar, third"[MeSH Terms] OR wisdom tooth[Text Word])
В MeSH зуб мудрости определяется как "molar, third".
На главную страницу >>>
© Гурьянова Наталья Николаевна