Визуализация молекул в JMol
Обзор белка клеточной инфазии Escherichia coli (PDB id 7AKI).
|
# |
Имена атомов |
Длина связи N—O, Å |
Угол N—H—O, ° |
|
Альфа-спирали |
|||
|
1 |
N(105MET)-O(101ALA) |
2,85 |
161,6 |
|
2 |
N(106HIS)-O(102SER) |
2,88 |
160,9 |
|
3 |
N(104MET)-O(100PHE) |
2,88 |
157,4 |
|
|
Среднее значение |
2,87 |
159,97 |
|
Бета-складки |
|||
|
1 |
N(78HIS)-O(89LEU) |
3,12 |
153,4 |
|
2 |
N(89LEU)-O(78HIS) |
2,82 |
162,8 |
|
3 |
N(80TRP)-O(87TYR) |
3,03 |
149,7 |
|
|
Среднее значение |
2,99 |
155,3 |
Вывод
Полученные средние значения расстояний между атомами в Альфа структурах составляют 2,87, в Бэтта структурах соответственно 2,99 Å , соответвующий водородным связям. Значения между друг другом отличаются на 0,12 Å . Средние значения углов водородных связей отличаются от идеального угла 180° не более чем на 30 °.