Практикум 14

Файл с проектом: файл

Протокол практикума

Ниже представлена информация о выбранной группе белков:

Весь проект покрашен в соответствии со схемой ClustralX, кроме рассматриваемых блоков.

Вертикальный плюс-блок

Для нахождения плюс-блоков использовались два паттерна: grpa[sta]ly и dysnfr. Данные блоки расположены на позициях с 32 по 37 и с 58 по 64 соответственно. Обозначение: V. Для удобства покрашен в бирюзовый цвет.

Частичный плюс-блок

Для нахождения частичных плюс-блоков использовался паттерн: pelf. Данный блок расположен на позициях с 10 по 13. Обозначение: P. Для удобства покрашен в фиолетовый цвет.

Минус-блок

Для данного блока паттерн составить нельзя, однако можно найти позиции. Для выбранных последовательностей оказалось сложным найти минус-блоки, так как в выравнивании почти все позиции соответствуют либо вертикальным плюс-блокам, либо частичным плюс-блокам, поэтому были выбраны позиции, в которых наблюдается наименьшее совпадение по последовательностям (позиии 47 и 51). Обозначение: M. Не имеет индивидуальной расскраски.