Частоты остатков в протеомах Escherichia coli K12
и
Bacillus amyloliquefaciens ATCC 23350.

На данной страничке я сравнил протеномы Bacillus amyloliquefaciens ATCC [1] и Escherichia coli K12 [2].

OrganismProteome IDЧисло последовательностейЧисло остатков
Escherichia coli K12 UP000000625 4306 1356195
Bacillus amyloliquefaciens ATCC 23350 UP000006562 3901 1148887
Таблица 1. Идентификаторы протеомов.

Остаток Bacillus amyloliquefaciens ATCC 23350Escherichia coli K12Разность
L10,7%9,5%1,2%
A9,5%8,2%1,3%
E5,8%7,2%1,4%
G7,4%7,2%0,2%
I6,0%7,1%1,1%
K4,4%7,0%2,6%
V7,1%6,7%0,4%
S5,8%6,2%0,4%
T5,4%5,5%0,1%
D5,2%5,2%0,0%
R5,5%4,4%1,1%
F3,9%4,4%0,5%
P4,4%3,8%0,6%
N3,9%3,8%0,1%
Q4,4%3,7%0,7%
Y2,8%3,4%0,6%
M2,8%2,8%0,0%
H2,3%2,2%0,1%
W1,5%1,0%0,5%
C1,6%0,8%0,8%
U0,0%0,0002%0,0002%
Таблица 2. Сравнение остатков.


У Bacillus amyloliquefaciens ATCC 23350 самые часто встречаемые остатки входят L,A,E, а у Escherichia coli K12 L,A,G. Самые редки у обоиз организмов схожие С,U,W.
Самая большая разность в пользу Bacillus amyloliquefaciens ATCC 23350 составляет 1,3% (A), а самая большая разность в пользу Escherichia coli K12 -2,6% (K).

Источники:

[1] Uniprot, Bacillus amyloliquefaciens ATCC 23350, 2017

[2] Uniprot, Escherichia coli K12, 2017


© Угольков Ярослав, 2017