Нуклеотидный blast
Задание 1
Послдеовательность FASTA, которую я использовал для выполнения данного задания тут.
Ниже приведен скрин полученных мной результатов в BLAST.
Рисунок 1. Результаты
Я смог определить организм до вида. Это Modiolus modiolus - крупная мидия, растущая до 22 см. Раковина пурпурная или синяя и прочная, с роговыми выступами, когда они молоды Внутренняя часть раковины белая с широкой паллиальной линией, большим передним аддуктивным мышечным швом и меньшим задним аддуктивным мышечным швом. Тело темно-оранжевого цвета.
Рисунок 2.Modiolus modiolus
Задание 2
Послдеовательность FASTA, которую я использовал для выполнения данного задания я выбрал другую, потому что работать с моей последовательностью не получалось: резальтытов всегда было больше 1000.
Новая последоватьность тут.
Выдача megablast:
Выдача discontigous megablast:
Выдача blastn:
Табличка с полученным результатими тут.
Задание 3
Задание 4
Для выполнения данного задания я взял организм Dendronephthya putteri. Всю информацию для google формы я взял тут.
© Угольков Ярослав, 2017