Нуклеотидный blast


Задание 1

Послдеовательность FASTA, которую я использовал для выполнения данного задания тут.
Ниже приведен скрин полученных мной результатов в BLAST.

Рисунок 1. Результаты

Я смог определить организм до вида. Это Modiolus modiolus - крупная мидия, растущая до 22 см. Раковина пурпурная или синяя и прочная, с роговыми выступами, когда они молоды Внутренняя часть раковины белая с широкой паллиальной линией, большим передним аддуктивным мышечным швом и меньшим задним аддуктивным мышечным швом. Тело темно-оранжевого цвета.

Рисунок 2.Modiolus modiolus

Задание 2

Послдеовательность FASTA, которую я использовал для выполнения данного задания я выбрал другую, потому что работать с моей последовательностью не получалось: резальтытов всегда было больше 1000. Новая последоватьность тут.


Выдача megablast:



Выдача discontigous megablast:



Выдача blastn:


Табличка с полученным результатими тут.

Задание 3

Задание 4

Для выполнения данного задания я взял организм Dendronephthya putteri. Всю информацию для google формы я взял тут.

© Угольков Ярослав, 2017